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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 转录组的拼接
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coffee159

金虫 (小有名气)

[求助] 转录组的拼接

测了4个样本的转录组，但对于拼接的过程不太了解。
4个样本的reads在一起进行DE novo拼接，拼接后得到转录本，这时的转录本有重复序列吗
如果有为什么那些有重复的序列没有拼接成一个转录本？
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1楼 2013-11-16 14:45:15
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gaoyang636

木虫 (著名写手)
reads数有多少？
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2楼2013-11-16 19:23:48
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coffee159

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-11-16 19:23:48
reads数有多少？

每一个有5千万左右。
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3楼2013-11-16 20:41:32
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gaoyang636

木虫 (著名写手)
读长多少？
每个sample 50M reads的确可以做assembly了
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4楼2013-11-18 14:04:13
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