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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 系统发育树的解读

红圈中的数字是啥意思,盼大牛不吝指点
系统发育树的解读
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dingzhuang

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励交流! 2013-10-30 22:15:26
gyesang: 回帖置顶 2013-10-30 22:15:27
zhangxingc: 金币+5, ★★★很有帮助, 感谢应助 2013-11-12 09:02:22
自展值(bootstrap value)。100为最高,产生过程和系统树建立时的对比运算有关。反映系统树以及系统距离的可信性,就是楼上说的正确性。
比如,图中的ATCC367T形成了一个进化距离很远的分枝,但是自展值只有不算高的86。假设这个是新种,恐怕在论文中也不能当有力论据。
另外,自展值在不同的运算模型中可能有不同的结果。
实验!成果!文章!毕业!工作!
12楼2013-10-30 09:55:50
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普通回帖

chang坤

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-10-29 16:32:48
应该是两者的相似百分比,主要是指基因的相似度,由此来确定二者进化的远近程度
为了理想拼了!
2楼2013-10-29 15:14:42
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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chang坤 at 2013-10-29 15:14:42
应该是两者的相似百分比,主要是指基因的相似度,由此来确定二者进化的远近程度

能将这个数据隐去吗
IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
3楼2013-10-29 16:19:58
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chang坤

金虫 (正式写手)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-10-29 23:52:01
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangxingc at 2013-10-29 16:19:58
能将这个数据隐去吗...

隐去的话,就不能具体的说明问题了吧。这是进化树的一部分啊
为了理想拼了!
4楼2013-10-29 19:07:38
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-10-29 23:52:10
zhangxingc: 金币+5, ★★★很有帮助, 感谢应助 2013-11-12 09:03:19
是进化树可信度评估的自举值,一般认为,当一个给定的内部树枝的自举值为95%或者更高,那么这个树枝的拓扑结构就可以认为是正确的。
5楼2013-10-29 20:16:02
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

bootstrap value.
6楼2013-10-29 20:21:15
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asr

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chang坤 at 2013-10-29 15:14:42
应该是两者的相似百分比,主要是指基因的相似度,由此来确定二者进化的远近程度

确定是基因的相似度吗?
貌似进化树是根据蛋白质来做的吧。
思想极度邪恶,勿怕勿怪!\(^o^)/~
7楼2013-10-29 21:13:34
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qibingli

金虫 (小有名气)

应该是表示两者的同源性为百分之多少吧.
天行健,君子以自强不息!
8楼2013-10-30 08:53:46
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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by lxj341401 at 2013-10-29 20:21:15
bootstrap value.

它的含义是什么呢?能解释一下下吗
IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
9楼2013-10-30 09:40:48
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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by qibingli at 2013-10-30 08:53:46
应该是表示两者的同源性为百分之多少吧.

这个想定是错误的
IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
10楼2013-10-30 09:41:45
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