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liliman2005

新虫 (初入文坛)

[求助] DNA序列比对

求助，在DNA序列比对中，比对的结果有很多省略号，咋回事呀？有图，，还有在找ORF时，起始密码子不在NCBI中搜到的起始密码子处。。在起始密码子前的一个ATG处，这是怎么回事？
DNA序列比对
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1楼 2013-10-19 23:41:03
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不叶珏

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流！ 2013-10-20 01:16:53
那个横杠”-“ 表示gap，就是上一条序列中有，本条序列中没有的意思。

ORF的问题，可能是从前一个ATG开始的话，仍然不会改变读码框，所以软件给出了一个更长的ORF序列
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借你一生好不好
2楼2013-10-19 23:48:29
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liliman2005

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 不叶珏 at 2013-10-19 23:48:29
那个横杠”-“ 表示gap，就是上一条序列中有，本条序列中没有的意思。

ORF的问题，可能是从前一个ATG开始的话，仍然不会改变读码框，所以软件给出了一个更长的ORF序列

非常感谢！对我帮助很大。。谢谢。。
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3楼2013-10-20 17:40:11
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liliman2005

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 不叶珏 at 2013-10-19 23:48:29
那个横杠”-“ 表示gap，就是上一条序列中有，本条序列中没有的意思。

ORF的问题，可能是从前一个ATG开始的话，仍然不会改变读码框，所以软件给出了一个更长的ORF序列

再请教一下，在NCBI中，找黑曲霉葡萄糖氧化酶基因序列，发现有四个，CDs 的product都是葡萄糖氧化酶，但是有的CDs是不连续的，是不是含有内含子（黑曲霉是真核的）？    这四篇文章是同一作者发表的，来源于同一菌株，这些葡萄糖氧化酶的ORF很不同（包括长度和序列），它们是同工酶吗？   同工酶的基因在一条染色体上吗？  （我在一条上找了一下其他的，没有找到）？    一种生物的不同染色体有可能编码同一种酶吗？
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4楼2013-10-20 18:09:12
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