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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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liliman2005

新虫 (初入文坛)

[求助] DNA序列比对

求助,在DNA序列比对中,比对的结果有很多省略号,咋回事呀?有图,,还有在找ORF时,起始密码子不在NCBI中搜到的起始密码子处。。在起始密码子前的一个ATG处,这是怎么回事?
DNA序列比对
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不叶珏

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2013-10-20 01:16:53
那个横杠”-“ 表示gap,就是上一条序列中有,本条序列中没有的意思。

ORF的问题,可能是从前一个ATG开始的话,仍然不会改变读码框,所以软件给出了一个更长的ORF序列
借你一生好不好
2楼2013-10-19 23:48:29
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liliman2005

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 不叶珏 at 2013-10-19 23:48:29
那个横杠”-“ 表示gap,就是上一条序列中有,本条序列中没有的意思。

ORF的问题,可能是从前一个ATG开始的话,仍然不会改变读码框,所以软件给出了一个更长的ORF序列

非常感谢!对我帮助很大。。谢谢。。
3楼2013-10-20 17:40:11
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liliman2005

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 不叶珏 at 2013-10-19 23:48:29
那个横杠”-“ 表示gap,就是上一条序列中有,本条序列中没有的意思。

ORF的问题,可能是从前一个ATG开始的话,仍然不会改变读码框,所以软件给出了一个更长的ORF序列

再请教一下,在NCBI中,找黑曲霉葡萄糖氧化酶基因序列,发现有四个,CDs 的product都是葡萄糖氧化酶,但是有的CDs是不连续的,是不是含有内含子(黑曲霉是真核的)?    这四篇文章是同一作者发表的,来源于同一菌株,这些葡萄糖氧化酶的ORF很不同(包括长度和序列),它们是同工酶吗?   同工酶的基因在一条染色体上吗?  (我在一条上找了一下其他的,没有找到)?    一种生物的不同染色体有可能编码同一种酶吗?
4楼2013-10-20 18:09:12
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