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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何确定某一蛋白是否是膜蛋白
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liouwzh

木虫 (正式写手)

[求助] 如何确定某一蛋白是否是膜蛋白

有没有什么生物信息学方法确定啊？
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1楼 2013-10-19 14:52:01
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liouwzh: 金币+3, ★有帮助 2013-10-22 08:46:26
如果只是针对某个蛋白的话
直接跑blast就可以了 看看类似蛋白的特征就可以了吧
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3楼2013-10-20 06:28:58
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lionllp

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-19 21:00:36
liouwzh: 金币+3, ★有帮助 2013-10-22 08:46:35
做个激光共聚焦就可以确定了，就想给人拍CT一样，一目了然。
赞一下(2人) 回复此楼
科研路漫漫，与君共相伴！
2楼2013-10-19 20:41:49
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liuhedong1817

木虫 (正式写手)

hello

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liouwzh: 金币+3, ★有帮助 2013-10-22 08:46:19
你应该有这个蛋白的氨基酸序列吧，可以在NCBI上预测一下这个蛋白的跨膜区域，如果一个蛋白有多个跨膜区域，这个蛋白很有可能是膜蛋白，或者是分泌型蛋白。如果没有跨膜区域，也不能确定你这个蛋白不是膜蛋白，因为有一部分的膜蛋白是镶嵌在膜内的蛋白，没有跨膜区域。希望能有帮助你。
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老婆的头像
4楼2013-10-21 10:51:38
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