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liouwzh

木虫 (正式写手)

[求助] 如何确定某一蛋白是否是膜蛋白

有没有什么生物信息学方法确定啊?
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lionllp

木虫 (正式写手)

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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-19 21:00:36
liouwzh: 金币+3, 有帮助 2013-10-22 08:46:35
做个激光共聚焦就可以确定了,就想给人拍CT一样,一目了然。
科研路漫漫,与君共相伴!
2楼2013-10-19 20:41:49
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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liouwzh: 金币+3, 有帮助 2013-10-22 08:46:26
如果只是针对某个蛋白的话
直接跑blast就可以了 看看类似蛋白的特征就可以了吧
3楼2013-10-20 06:28:58
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liuhedong1817

木虫 (正式写手)

hello

【答案】应助回帖

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liouwzh: 金币+3, 有帮助 2013-10-22 08:46:19
你应该有这个蛋白的氨基酸序列吧,可以在NCBI上预测一下这个蛋白的跨膜区域,如果一个蛋白有多个跨膜区域,这个蛋白很有可能是膜蛋白,或者是分泌型蛋白。如果没有跨膜区域,也不能确定你这个蛋白不是膜蛋白,因为有一部分的膜蛋白是镶嵌在膜内的蛋白,没有跨膜区域。希望能有帮助你。
老婆的头像
4楼2013-10-21 10:51:38
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