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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

[求助] 好心人帮助我看看DNA电泳图吧!

Sample Text
DNA条带下面这一团的东西是什么啊?
我加了RNA酶,蛋白也反复抽提了4次,也不太像DNA降解,求大神帮忙解惑!!
好心人帮助我看看DNA电泳图吧!
Administrator 2013-09-28 20 时 36 分.jpg
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香分子生物期待你的精彩。 2013-10-01 21:37:45
觉得像是没除干净的RNA。
2楼2013-10-01 00:21:09
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普通回帖

白菜吃虫

铜虫 (小有名气)


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香分子生物期待你的精彩。 2013-10-01 21:37:54
这是什么的DNA啊,基因组?因为我看到怎么还有个跑慢一点儿的,那个比较干净。你的材料有没有什么特殊的物质不好抽提出来呢。放一晚,第二天再电泳,如果是RNA估计就没了吧。
3楼2013-10-01 00:32:37
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DAX1

新虫 (小有名气)


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香分子生物期待你的精彩。 2013-10-01 21:38:02
感觉不太像rna啊,如果楼主是自己配置试剂提质粒,可以在溶液1里面加一点rna酶,跑电泳用基本看不到rna的。我现在懒,不愿意用试剂盒提小提,都直接溶液123然后异丙醇沉淀,乙醇洗一遍,效果一直很稳定很好。
题外话,我做了近8年的生物实验,小提用过自己配置试剂,也用过各种试剂盒,来了小木虫才发现提质粒竟然会出现那么多的问题,而且是我闻所未闻的。
4楼2013-10-01 04:05:40
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

墨绿的下午茶: 回帖置顶 2013-10-01 12:28:53
不好意思各位啊,我没说清楚,我的材料是植物,我从高原带回来,用硅胶风干保存的。所以它并不是一个新鲜材料,是干了的。
用的是CTAB法提植物DNA,应该不是RNA,那团亮的东西对应的marker的大小是在5KB左右呢!
最后就是,用这个植物的不同的组织部位来提取DNA的话,根就不会出现这样的结果、茎出现的少、叶出现的多、花出现的更多。
所以,大神们,帮忙解惑啊!会不会是色素的问题啊?或者抽提不干净?但是我抽提4-5次呢啊!
5楼2013-10-01 12:25:46
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 白菜吃虫 at 2013-10-01 00:32:37
这是什么的DNA啊,基因组?因为我看到怎么还有个跑慢一点儿的,那个比较干净。你的材料有没有什么特殊的物质不好抽提出来呢。放一晚,第二天再电泳,如果是RNA估计就没了吧。

不好意思各位啊,我没说清楚,我的材料是植物,我从高原带回来,用硅胶风干保存的。所以它并不是一个新鲜材料,是干了的。
用的是CTAB法提植物DNA,应该不是RNA,那团亮的东西对应的marker的大小是在5KB左右呢!
最后就是,用这个植物的不同的组织部位来提取DNA的话,根就不会出现这样的结果、茎出现的少、叶出现的多、花出现的更多。
所以,大神们,帮忙解惑啊!会不会是色素的问题啊?或者抽提不干净?但是我抽提4-5次呢啊!
6楼2013-10-01 12:28:05
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 白菜吃虫 at 2013-10-01 00:32:37
这是什么的DNA啊,基因组?因为我看到怎么还有个跑慢一点儿的,那个比较干净。你的材料有没有什么特殊的物质不好抽提出来呢。放一晚,第二天再电泳,如果是RNA估计就没了吧。

放一晚?抽提4、5次呢?哪次抽提放一晚?还是说,抽提时间长一点,但是能更具体点么?
7楼2013-10-01 12:32:12
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xl_dut

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香分子生物期待你的精彩。 2013-10-01 21:38:12
貌似花青素在同样波长的紫外光照射下也会有荧光产生。
一日之计在于昨天!
8楼2013-10-01 13:12:35
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by xl_dut at 2013-10-01 13:12:35
貌似花青素在同样波长的紫外光照射下也会有荧光产生。

在机器上测比值的时候,260比280有的能高达4点多,应该是色素的问题,但是这个和我电泳图有联系吗?
9楼2013-10-01 14:06:38
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白菜吃虫

铜虫 (小有名气)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-10-04 00:51:32
引用回帖:
6楼: Originally posted by 墨绿的下午茶 at 2013-10-01 12:28:05
不好意思各位啊,我没说清楚,我的材料是植物,我从高原带回来,用硅胶风干保存的。所以它并不是一个新鲜材料,是干了的。
用的是CTAB法提植物DNA,应该不是RNA,那团亮的东西对应的marker的大小是在5KB左右呢!
...

你查查资料看这种植物的DNA一般都怎么提取。
我说放一晚是说溶解好了放4度一晚上,再来电泳。这时RNA自己就降解了,至少比以前少。
你可以试一试基因组DNA提取试剂盒。
我的经验,抽提太多次并不是很好,对DNA损伤比较大,甚至造成DNA降解,抽三次就不少了,可以少吸取上清,防止把中间的蛋白吸上来。
另外,这些杂质如果不影响你下面的实验就没关系了。
10楼2013-10-01 16:13:23
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