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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

[求助] 好心人帮助我看看DNA电泳图吧！

Sample Text
DNA条带下面这一团的东西是什么啊？
我加了RNA酶，蛋白也反复抽提了4次，也不太像DNA降解，求大神帮忙解惑！！
好心人帮助我看看DNA电泳图吧！
Administrator 2013-09-28 20 时 36 分.jpg
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1楼 2013-09-30 21:49:43
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
墨绿的下午茶: 回帖置顶 2013-10-01 12:28:53
不好意思各位啊，我没说清楚，我的材料是植物，我从高原带回来，用硅胶风干保存的。所以它并不是一个新鲜材料，是干了的。
用的是CTAB法提植物DNA，应该不是RNA，那团亮的东西对应的marker的大小是在5KB左右呢！
最后就是，用这个植物的不同的组织部位来提取DNA的话，根就不会出现这样的结果、茎出现的少、叶出现的多、花出现的更多。
所以，大神们，帮忙解惑啊！会不会是色素的问题啊？或者抽提不干净？但是我抽提4-5次呢啊！
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5楼2013-10-01 12:25:46
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 白菜吃虫 at 2013-10-01 00:32:37
这是什么的DNA啊，基因组？因为我看到怎么还有个跑慢一点儿的，那个比较干净。你的材料有没有什么特殊的物质不好抽提出来呢。放一晚，第二天再电泳，如果是RNA估计就没了吧。

不好意思各位啊，我没说清楚，我的材料是植物，我从高原带回来，用硅胶风干保存的。所以它并不是一个新鲜材料，是干了的。
用的是CTAB法提植物DNA，应该不是RNA，那团亮的东西对应的marker的大小是在5KB左右呢！
最后就是，用这个植物的不同的组织部位来提取DNA的话，根就不会出现这样的结果、茎出现的少、叶出现的多、花出现的更多。
所以，大神们，帮忙解惑啊！会不会是色素的问题啊？或者抽提不干净？但是我抽提4-5次呢啊！
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6楼2013-10-01 12:28:05
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
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3楼: Originally posted by 白菜吃虫 at 2013-10-01 00:32:37
这是什么的DNA啊，基因组？因为我看到怎么还有个跑慢一点儿的，那个比较干净。你的材料有没有什么特殊的物质不好抽提出来呢。放一晚，第二天再电泳，如果是RNA估计就没了吧。

放一晚？抽提4、5次呢？哪次抽提放一晚？还是说，抽提时间长一点，但是能更具体点么？
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7楼2013-10-01 12:32:12
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
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8楼: Originally posted by xl_dut at 2013-10-01 13:12:35
貌似花青素在同样波长的紫外光照射下也会有荧光产生。

在机器上测比值的时候，260比280有的能高达4点多，应该是色素的问题，但是这个和我电泳图有联系吗？
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9楼2013-10-01 14:06:38
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
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10楼: Originally posted by 白菜吃虫 at 2013-10-01 16:13:23
你查查资料看这种植物的DNA一般都怎么提取。
我说放一晚是说溶解好了放4度一晚上，再来电泳。这时RNA自己就降解了，至少比以前少。
你可以试一试基因组DNA提取试剂盒。
我的经验，抽提太多次并不是很好，对DNA损 ...

要测序的，要求挺高的
已经将样品放过一晚了，然后电泳了，结果没有任何变化，还是那样
我的植物现在没有文献报道过关于它DNA提取等文献，有关它DNA的研究的报道基本找不到2篇
不知道试剂盒是否会有帮助，但是别的实验室的有个师姐说，CTAB提植物DNA比试剂盒好用
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11楼2013-10-01 16:40:47
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
13楼: Originally posted by xl_dut at 2013-10-01 19:59:09
认为可能是大量花青素与少量的较短片段的DNA结合，产生了较强的干扰信号！...

我也觉得是色素对机器产生的影响！有没有办法出去这些色素呢？
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14楼2013-10-01 20:54:14
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
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15楼: Originally posted by ifyousee at 2013-10-01 21:33:47
这个目测是退火温度低了，提高几度应该就可以了


这个只是DNA提取之后的电泳图
不是PCR的电泳图
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16楼2013-10-02 10:38:23
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
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17楼: Originally posted by hkqgeoffrey at 2013-10-02 15:21:50
楼主这个电泳跑得时间再长点吧，有点没跑开，那么大块胶太节约的有点浪费了吧？再跑会说不定还有别的条带

别的条带？如果有，应该就是RNA条带了。我用RNA酶处理了，RNA酶绝对没有问题，另外如果是蛋白条带，应该在我DNA条带的上面才是啊！
我拿别的植物做DNA提取，同样的方法，同样的试剂，一点问题也没有！不是实验的问题，而是材料的问题，现在不清楚的是，材料的哪些成分对我DNA提取产生了干扰！
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22楼2013-10-07 21:42:50
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
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19楼: Originally posted by snzydong at 2013-10-02 22:25:01
都是其他杂质，如果下游实验要求不高，可以直接做，或者换试剂盒试试

要测序的，就是舍不得花钱才用CTAB的，而且CTAB法提其他植物没有问题，就这次的植物有问题了，而且问了许多教授...答案都是，没见过！
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23楼2013-10-07 21:44:55
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