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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

[求助] 好心人帮助我看看DNA电泳图吧！

Sample Text
DNA条带下面这一团的东西是什么啊？
我加了RNA酶，蛋白也反复抽提了4次，也不太像DNA降解，求大神帮忙解惑！！
好心人帮助我看看DNA电泳图吧！
Administrator 2013-09-28 20 时 36 分.jpg
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1楼 2013-09-30 21:49:43
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香分子生物期待你的精彩。 2013-10-01 21:37:45
觉得像是没除干净的RNA。
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2楼2013-10-01 00:21:09
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普通回帖

白菜吃虫

铜虫 (小有名气)
★
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香分子生物期待你的精彩。 2013-10-01 21:37:54
这是什么的DNA啊，基因组？因为我看到怎么还有个跑慢一点儿的，那个比较干净。你的材料有没有什么特殊的物质不好抽提出来呢。放一晚，第二天再电泳，如果是RNA估计就没了吧。
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3楼2013-10-01 00:32:37
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DAX1

新虫 (小有名气)
★
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香分子生物期待你的精彩。 2013-10-01 21:38:02
感觉不太像rna啊，如果楼主是自己配置试剂提质粒，可以在溶液1里面加一点rna酶，跑电泳用基本看不到rna的。我现在懒，不愿意用试剂盒提小提，都直接溶液123然后异丙醇沉淀，乙醇洗一遍，效果一直很稳定很好。
题外话，我做了近8年的生物实验，小提用过自己配置试剂，也用过各种试剂盒，来了小木虫才发现提质粒竟然会出现那么多的问题，而且是我闻所未闻的。
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4楼2013-10-01 04:05:40
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
墨绿的下午茶: 回帖置顶 2013-10-01 12:28:53
不好意思各位啊，我没说清楚，我的材料是植物，我从高原带回来，用硅胶风干保存的。所以它并不是一个新鲜材料，是干了的。
用的是CTAB法提植物DNA，应该不是RNA，那团亮的东西对应的marker的大小是在5KB左右呢！
最后就是，用这个植物的不同的组织部位来提取DNA的话，根就不会出现这样的结果、茎出现的少、叶出现的多、花出现的更多。
所以，大神们，帮忙解惑啊！会不会是色素的问题啊？或者抽提不干净？但是我抽提4-5次呢啊！
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5楼2013-10-01 12:25:46
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 白菜吃虫 at 2013-10-01 00:32:37
这是什么的DNA啊，基因组？因为我看到怎么还有个跑慢一点儿的，那个比较干净。你的材料有没有什么特殊的物质不好抽提出来呢。放一晚，第二天再电泳，如果是RNA估计就没了吧。

不好意思各位啊，我没说清楚，我的材料是植物，我从高原带回来，用硅胶风干保存的。所以它并不是一个新鲜材料，是干了的。
用的是CTAB法提植物DNA，应该不是RNA，那团亮的东西对应的marker的大小是在5KB左右呢！
最后就是，用这个植物的不同的组织部位来提取DNA的话，根就不会出现这样的结果、茎出现的少、叶出现的多、花出现的更多。
所以，大神们，帮忙解惑啊！会不会是色素的问题啊？或者抽提不干净？但是我抽提4-5次呢啊！
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6楼2013-10-01 12:28:05
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 白菜吃虫 at 2013-10-01 00:32:37
这是什么的DNA啊，基因组？因为我看到怎么还有个跑慢一点儿的，那个比较干净。你的材料有没有什么特殊的物质不好抽提出来呢。放一晚，第二天再电泳，如果是RNA估计就没了吧。

放一晚？抽提4、5次呢？哪次抽提放一晚？还是说，抽提时间长一点，但是能更具体点么？
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7楼2013-10-01 12:32:12
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xl_dut

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香分子生物期待你的精彩。 2013-10-01 21:38:12
貌似花青素在同样波长的紫外光照射下也会有荧光产生。
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一日之计在于昨天！
8楼2013-10-01 13:12:35
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by xl_dut at 2013-10-01 13:12:35
貌似花青素在同样波长的紫外光照射下也会有荧光产生。

在机器上测比值的时候，260比280有的能高达4点多，应该是色素的问题，但是这个和我电泳图有联系吗？
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9楼2013-10-01 14:06:38
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白菜吃虫

铜虫 (小有名气)
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2013-10-04 00:51:32
引用回帖:
6楼: Originally posted by 墨绿的下午茶 at 2013-10-01 12:28:05
不好意思各位啊，我没说清楚，我的材料是植物，我从高原带回来，用硅胶风干保存的。所以它并不是一个新鲜材料，是干了的。
用的是CTAB法提植物DNA，应该不是RNA，那团亮的东西对应的marker的大小是在5KB左右呢！
...

你查查资料看这种植物的DNA一般都怎么提取。
我说放一晚是说溶解好了放4度一晚上，再来电泳。这时RNA自己就降解了，至少比以前少。
你可以试一试基因组DNA提取试剂盒。
我的经验，抽提太多次并不是很好，对DNA损伤比较大，甚至造成DNA降解，抽三次就不少了，可以少吸取上清，防止把中间的蛋白吸上来。
另外，这些杂质如果不影响你下面的实验就没关系了。
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10楼2013-10-01 16:13:23
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