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ma_xiaowen

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-10-08 20:17:16
可以确定的是没有蛋白 可能是RNA吧 楼主可以多消解些时间 另外就是可以试一下试剂盒的方法 对比一下 选择合适的方法
21楼2013-10-02 23:31:29
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
17楼: Originally posted by hkqgeoffrey at 2013-10-02 15:21:50
楼主这个电泳跑得时间再长点吧,有点没跑开,那么大块胶太节约的有点浪费了吧?再跑会说不定还有别的条带

别的条带?如果有,应该就是RNA条带了。我用RNA酶处理了,RNA酶绝对没有问题,另外如果是蛋白条带,应该在我DNA条带的上面才是啊!
我拿别的植物做DNA提取,同样的方法,同样的试剂,一点问题也没有!不是实验的问题,而是材料的问题,现在不清楚的是,材料的哪些成分对我DNA提取产生了干扰!
22楼2013-10-07 21:42:50
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
19楼: Originally posted by snzydong at 2013-10-02 22:25:01
都是其他杂质,如果下游实验要求不高,可以直接做,或者换试剂盒试试

要测序的,就是舍不得花钱才用CTAB的,而且CTAB法提其他植物没有问题,就这次的植物有问题了,而且问了许多教授...答案都是,没见过!
23楼2013-10-07 21:44:55
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
18楼: Originally posted by sunshine巧儿 at 2013-10-02 21:47:08
你好,首先这个应该不是RNA,因为他们一般都很小,不可能在这个位置,第二,也不是蛋白质,因为蛋白质会在胶空位置停滞,这个可能性最大的是DNA的讲解,因为你的材料不新鲜,还有一种可能就是你提取的时候有断裂,动 ...

我拿别的植物做DNA提取,同样的方法,同样的试剂,一点问题也没有!不是实验的问题,而是材料的问题,现在不清楚的是,材料的哪些成分对我DNA提取产生了干扰!
24楼2013-10-07 21:46:04
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hkqgeoffrey

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
22楼: Originally posted by 墨绿的下午茶 at 2013-10-07 21:42:50
别的条带?如果有,应该就是RNA条带了。我用RNA酶处理了,RNA酶绝对没有问题,另外如果是蛋白条带,应该在我DNA条带的上面才是啊!
我拿别的植物做DNA提取,同样的方法,同样的试剂,一点问题也没有!不是实验的问 ...

污染或者DNA断裂都可以产生多余条带,此外引物含有非特异性序列进行PCR所产生的产物也有可能产生多种非特异条带
兴趣是第一导师,我爱它,因此我毫无疲倦的探索
25楼2013-10-08 11:18:09
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黑盖儿

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-10-08 20:17:25
我觉得有可能是你抽提的基因组降解了,那个亮带就是降解后的产物。不知你有没有注意到,那条带越亮,你的目标条带就越暗。
我给不了你宝马香车,锦衣玉食,但我会用一辈子去疼你,爱你,保护你
26楼2013-10-08 11:52:16
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crest0708

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-10-08 20:17:32
你倒数第3条带,是什么样品,提的挺好啊
提基因组,一次还提这么多样品的,你真能干。
要是想让大家分析,把步骤贴出来吧,样品组成也最好详细的说明一下。同一个PROTOCOL,一个人做一种结果,有的时候就是手抖了一下


我推测是你样品污染了别的细菌或者真菌,你可以查查有没有5KB左右基因组的生物。如果是降解应该更弥散,如果是RNA,我专门提RNA都没你这个量大。
27楼2013-10-08 14:07:18
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
26楼: Originally posted by 黑盖儿 at 2013-10-08 11:52:16
我觉得有可能是你抽提的基因组降解了,那个亮带就是降解后的产物。不知你有没有注意到,那条带越亮,你的目标条带就越暗。

这个我注意了,但是降解的话,应该是那种弥散状,不像我这个样的啊!
28楼2013-10-08 14:31:44
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
25楼: Originally posted by hkqgeoffrey at 2013-10-08 11:18:09
污染或者DNA断裂都可以产生多余条带,此外引物含有非特异性序列进行PCR所产生的产物也有可能产生多种非特异条带...

我的这个只是DNA提取,没有做PCR!
若果是我动作大,DNA断裂成小片段,那也不应该是一团那样的亮的啊!污染的可能较小吧!
29楼2013-10-08 14:33:31
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墨绿的下午茶

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
27楼: Originally posted by crest0708 at 2013-10-08 14:07:18
你倒数第3条带,是什么样品,提的挺好啊
提基因组,一次还提这么多样品的,你真能干。
要是想让大家分析,把步骤贴出来吧,样品组成也最好详细的说明一下。同一个PROTOCOL,一个人做一种结果,有的时候就是手抖 ...

我之前是提RNA的,RNA这个材料没问题,图也很漂亮,RNA已经要送公司测序了!
现在是提DNA,本来也是要打算测序的。因为实验室CTAB法已经很成熟了,几个师姐拿不同材料提取都没有问题,到我这里当然也是用CTAB继续提了啊,但是就出现胶上面的问题了。
但是我换别的材料就没有问题,胶图也很好!而且这种现象好几个教授都没见过,初步怀疑是素色的问题。
我一次做48份DNA提取,而且就这个植物,不同组织部位的DNA提取结果,胶图都不同,特别神奇!根和茎基本不会出现这种结果,叶和花基本都出现DNA主带下面一团亮的,另外,不同取材亮也不同,就花来说,量少不出现问题,量多就出现问题!
30楼2013-10-08 14:38:53
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