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XLK2011

木虫 (正式写手)

[求助] 多重PCR,共有四个位点扩增,其中有一个位点的扩增效率很低,应该怎么调整反应体系?

多重PCR,共有四个位点扩增,其中有一个位点的扩增效率很低。单独就这一个位点做单重PCR,扩增曲线还可以,多重PCR时,就很差,应该怎么调整反应体系?
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SHIPINANGEL

新虫 (初入文坛)

你好,请问你的问题解决了吗?我也出现了这种问题,请问你是怎么解决的?
3楼2016-01-20 08:44:16
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keydy

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待你更多精彩 。 2013-09-25 15:43:19
单独扩增曲线OK,说明引物设计没有问题。而多重扩增出现一个点较弱,就体系而言,我建议:
1.增加那个较"弱"的点的引物量,或者/并且减少"强"点的引物量,这点比较难把握,因为不同基因序列相对的引物终浓度有明显的差异 (0.04–0.6 μ M) ,这很大程度上取决于经验。
2.至于其它的组分,如dNTP,MgCl2,Buffer,模板和酶甚至佐剂我都认为没有优化的必要。
你只是提问了“反应体系”,说明你对PCR循环参数什么的很有信心,我也就不画蛇添足了。
祝好运。
2楼2013-09-25 10:23:56
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