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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 怎么用gromacs模拟混合溶剂？跪求大牛指导。。。
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eastlife

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1楼 2013-08-27 15:45:46
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huyingdamon

银虫 (小有名气)
兄弟 看到你的帖子 我现在跟你一样 着急得很 我也是需要邮寄溶剂模型 我有了乙腈top跟gro后，把它当小分子一样插进去 跟你的方法差不多我倒是插进去了 能量最小化还好好地 但一到NVT平衡就运行不了了 不知道您现在解决这个问题了没 还有你说在top中不显示加入甲醇的数目 这是对的 只有gromacs自带的水溶剂加进去才会显示 其他溶剂要自己在top中加进去的
赞一下 回复此楼
10楼2013-09-20 10:42:38
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