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M110935

金虫 (小有名气)

[求助] TA克隆求助

本人前面做TA克隆,将PCR产物(1000bp多点)切胶回收后连接pMD19-T simple载体(体系:载体1uL,PCR产物4uL,Solution I 5uL),16 ℃连接1h(说明书要求30min),先后转化DH5α感受态(鼎国)和Top10(天根),涂氨苄平板,都不长菌落。
请各位虫友帮忙分析一下,感激不尽!
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冰风颤木

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
M110935: 金币+3, ★★★很有帮助, 实在太感谢你了。今天我就按你说的去做 2013-08-26 14:34:44
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-26 18:34:51
gyesang: 回帖置顶 2013-08-26 18:34:53
楼主你好 曾经我也遇到这样的问题 现在基本上不会了
我的解决办法如下:
1、你的连接体系没有问题 我的大小也是和你的差不多大 也是这么连接的,我不是16℃连接1小时,你可以试试4℃过夜连接试试,我比较过二者的差异性,后者的效果很好,我一开始是16℃连接长的不多或者很少,但是改用4℃过夜连接,每次都会长出来,且转化子很多;
2、你的感受态很可能有问题,你可以自己试试做下感受态,感受态在制作和使用的过程中必须要全程冰浴,如果你没有全程冰浴,很可能转化效率就会很低,基本上没有转化子。
最后你试试吧,如果还有问题 可以联系我啊 希望你顺利解决问题!
船到桥头自然直
11楼2013-08-26 14:26:31
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yujitianqing

铁虫 (正式写手)


gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2013-08-27 22:28:23
引用回帖:
8楼: Originally posted by M110935 at 2013-08-26 14:14:03
载体与产物1:4(要求1:2-10),转化步骤我应该能保证没有问题,因为TA克隆我曾经做过,没出什么问题。不过转化是恢复抗性用的是LB培养基,不知道有没有影响,SOC我们这都没听过。还有,怎么判断PCR产物末端是否有游 ...

SOC培养基营养更为丰富,可用于转化前的恢复培养。SOC具体配方可以百度下。
有无A与所用的DNA聚合酶有关,Taq酶扩增的产物末端均携带游离的A,TA克隆是针对这一特点而开发的产品,而有些高保真酶末端是平端。做个对照组,一步步找找原因吧,1kb左右的插入片段做TA克隆不会很难。
14楼2013-08-26 18:55:20
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普通回帖

guxinhan123

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-25 22:38:45
M110935: 金币+1, 有帮助, 载体是新买的,目前怀疑是感受态的问题,在重新做。谢谢 2013-08-26 14:09:16
换个新的载体或者重做感受态试下
2楼2013-08-25 21:11:05
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子墨无极

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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回收产物浓度和纯度怎么样
追求无止境
3楼2013-08-25 22:04:26
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
M110935: 金币+1, ★★★很有帮助, 用rTaq酶,前面做的时候没设对照,后面会试试,谢谢。 2013-08-26 14:10:13
PCR是用的Taq酶吗?PCR产物回收后定量,按照浓度建立连接体系。此外,连接和转化是最好有正负对照。如果目标克隆什么都不长,硬参考正对照是否做出来。
4楼2013-08-25 23:21:55
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yujitianqing

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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M110935: 金币+1, ★★★很有帮助 2013-08-26 14:13:59
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-26 18:34:14
个人觉得购买的感受态、连接载体试剂盒不会有问题。
载体和PCR产物比例有没问题?
PCR产物末端是否有游离的A?
转化步骤是否有问题?经过热激吗?转化过程中加培养基恢复抗氨苄的培养基最好是SOC。
氨苄浓度做好不要太高,50ng/ml就可以了。
5楼2013-08-26 09:02:01
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jacky1985310

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
M110935: 金币+1, ★★★很有帮助 2013-08-26 14:14:11
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-26 18:34:21
请问你PCR时使用的是什么酶?如果是高保真的诸如PRIMESTAR的酶,那么在你产物的两端是没有加A的,高保真酶会将其切除。这种情况下你要再用taq酶72℃跑个5分钟,加上A后再进行连接就可以了。
6楼2013-08-26 10:52:54
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sxxuan

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
M110935: 金币+1, ★★★很有帮助 2013-08-26 14:14:55
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-08-26 18:34:29
前面的虫友都讲了pcr产物加A和质量之类的问题了
我曾经比较过,pMD18-T连接30min或1h的效率其实是比较低的,估计这个pMD19可能也是差不多。如果可以的话,连接过夜,或者22℃连接2h,效果会好很多。
其实如果在PCR产物正常加A,产物质量也高,感受态也好,转化步骤也正常的情况下,就算连接不彻底,转化也不会有太大问题。但问题就是你得确保上述都很好。
你的日子如何,你的力量也必如何!
7楼2013-08-26 11:14:07
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M110935

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by yujitianqing at 2013-08-26 09:02:01
个人觉得购买的感受态、连接载体试剂盒不会有问题。
载体和PCR产物比例有没问题?
PCR产物末端是否有游离的A?
转化步骤是否有问题?经过热激吗?转化过程中加培养基恢复抗氨苄的培养基最好是SOC。
氨苄浓度做好 ...

载体与产物1:4(要求1:2-10),转化步骤我应该能保证没有问题,因为TA克隆我曾经做过,没出什么问题。不过转化是恢复抗性用的是LB培养基,不知道有没有影响,SOC我们这都没听过。还有,怎么判断PCR产物末端是否有游离的A?谢谢
8楼2013-08-26 14:14:03
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M110935

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by jacky1985310 at 2013-08-26 10:52:54
请问你PCR时使用的是什么酶?如果是高保真的诸如PRIMESTAR的酶,那么在你产物的两端是没有加A的,高保真酶会将其切除。这种情况下你要再用taq酶72℃跑个5分钟,加上A后再进行连接就可以了。

用的rTaq酶,应该是没有什么问题的
9楼2013-08-26 14:14:35
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M110935

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by sxxuan at 2013-08-26 11:14:07
前面的虫友都讲了pcr产物加A和质量之类的问题了
我曾经比较过,pMD18-T连接30min或1h的效率其实是比较低的,估计这个pMD19可能也是差不多。如果可以的话,连接过夜,或者22℃连接2h,效果会好很多。
其实如果在PC ...

第一次做,也是16℃连16h,后来看说明书只要30min,所以就改为连接1h,反正是都没做出来
10楼2013-08-26 14:15:45
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