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冰风颤木

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
M110935: 金币+3, ★★★很有帮助, 实在太感谢你了。今天我就按你说的去做 2013-08-26 14:34:44
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-26 18:34:51
gyesang: 回帖置顶 2013-08-26 18:34:53
楼主你好 曾经我也遇到这样的问题 现在基本上不会了
我的解决办法如下:
1、你的连接体系没有问题 我的大小也是和你的差不多大 也是这么连接的,我不是16℃连接1小时,你可以试试4℃过夜连接试试,我比较过二者的差异性,后者的效果很好,我一开始是16℃连接长的不多或者很少,但是改用4℃过夜连接,每次都会长出来,且转化子很多;
2、你的感受态很可能有问题,你可以自己试试做下感受态,感受态在制作和使用的过程中必须要全程冰浴,如果你没有全程冰浴,很可能转化效率就会很低,基本上没有转化子。
最后你试试吧,如果还有问题 可以联系我啊 希望你顺利解决问题!
船到桥头自然直
11楼2013-08-26 14:26:31
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wang6rrtoy

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-08-26 18:34:59
M110935: 金币+1, ★★★很有帮助 2013-08-26 18:39:13
在下也是用的pMD-19,因为我的目的片段至于250bp所以16度链接30min就好了   菌能长出来,但是比较奇葩的是没有蓝斑,但是菌液PCR能P出来,问过卖试剂盒的,他说能P出来就说明我的链接效率很高。你的1000bp的话估计得3h以上会好一点,还有就是确定下你的感受态细胞的浓度,如果浓度太低,而你涂平板时加的又少,很可能张不出来。
好好学习
12楼2013-08-26 17:06:45
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M110935

金虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by wang6rrtoy at 2013-08-26 17:06:45
在下也是用的pMD-19,因为我的目的片段至于250bp所以16度链接30min就好了   菌能长出来,但是比较奇葩的是没有蓝斑,但是菌液PCR能P出来,问过卖试剂盒的,他说能P出来就说明我的链接效率很高。你的1000bp的话估计得 ...

谢谢回复。前一次我还特地离心去掉大部分培养基,然后重悬。每次涂板都用200uL
13楼2013-08-26 18:39:57
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yujitianqing

铁虫 (正式写手)


gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2013-08-27 22:28:23
引用回帖:
8楼: Originally posted by M110935 at 2013-08-26 14:14:03
载体与产物1:4(要求1:2-10),转化步骤我应该能保证没有问题,因为TA克隆我曾经做过,没出什么问题。不过转化是恢复抗性用的是LB培养基,不知道有没有影响,SOC我们这都没听过。还有,怎么判断PCR产物末端是否有游 ...

SOC培养基营养更为丰富,可用于转化前的恢复培养。SOC具体配方可以百度下。
有无A与所用的DNA聚合酶有关,Taq酶扩增的产物末端均携带游离的A,TA克隆是针对这一特点而开发的产品,而有些高保真酶末端是平端。做个对照组,一步步找找原因吧,1kb左右的插入片段做TA克隆不会很难。
14楼2013-08-26 18:55:20
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M110935

金虫 (小有名气)

引用回帖:
14楼: Originally posted by yujitianqing at 2013-08-26 18:55:20
SOC培养基营养更为丰富,可用于转化前的恢复培养。SOC具体配方可以百度下。
有无A与所用的DNA聚合酶有关,Taq酶扩增的产物末端均携带游离的A,TA克隆是针对这一特点而开发的产品,而有些高保真酶末端是平端。做个 ...

:hand感谢
15楼2013-08-26 19:57:48
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weithermo

新虫 (初入文坛)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-27 22:28:32
没有转化子刻有多种原因,因而尽量用阳性对照帮你查找原因。首先,就象有人建议的一样,要知道PCR所用的DNA聚合酶。并使其和链接载体匹配。Taq之类的每要连到TA克隆载体,而Phusion和Pfu不产生多余的A,是钝端连接。你可以试一下赛默飞世尔的CloneJET PCR 的克隆试剂盒,无论钝端和粘端都何以。5到10分钟室温处理后即可转化。此试剂盒的另个好处是生长的菌落99%都含有克隆·片段。建议每次转化都用很少量的质粒做阳性对照。
16楼2013-08-27 03:27:49
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hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
M110935: 金币+1, ★★★很有帮助 2013-08-27 15:15:58
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-08-27 22:28:37
建议:
1.设立其他质粒的阳性对照。实验室随便找个同抗性质粒,大倍数稀释(100倍至1000倍),作为对照。
2.感受态的阴性对照(无质粒)抗性平板不生长(防止抗生素失效引起的假阳性),还要用无抗性平板看热激后感受态细胞的存活情况
3.4℃连接过夜(PCR产物的比例可以提高,我一般都是1:10~1:20左右)效率低的话就4℃多放几天,我做过1周的,没事。
4.转化时的热激时间影响很大,我一般是45s。你可以参照2中的菌落数,调整。
5.转化时的晃动,尤其是剧烈的摇晃,跑步上下楼等。冰浴。扩增的转速不可过快(千万别放抗生素)
17楼2013-08-27 09:11:34
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雙子の殇

金虫 (正式写手)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2013-08-27 22:28:45
1000bp应该是很好连的,我们用的PMD18-T,4℃过夜或者16℃都可以
18楼2013-08-27 16:29:14
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