| 查看: 3486 | 回复: 6 | |||
hwceng0816木虫 (著名写手)
|
[求助]
用lammps做分子动力学新手求助
|
|
虫友们好，我现在开始需要用lammps这个软件做分子动力学模拟，折腾了一段时间了，还是没搞明白我现在该怎么去进行，尤其是在装软件这一点大家的说法度不一致，有的说去linux下装lammps，关键我没有linux这方面的基础，很吃力，我想在win下做计算不知道可以不可以？前期这样，后期体系大的话再去考虑linux。 那现在的问题是我该怎么去安装这个软件，在win还是在linux，（现在的硬件是几台配置比较好的台式机） 还有就是模拟这一块的模型是怎么去弄的？需要其他软件来建立模型吗。我做的是晶界的模拟，可以不可以在in文件里面直接写出模型？ 还请有经验的指导一二，不胜感激！ |
回复此楼» 猜你喜欢
极限拉扯，如何抉择
已经有10人回复
-
入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍
已经有6人回复
-
OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？
已经有8人回复
-
课题组会帮你通过考核么？
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有10人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有8人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有7人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助LAMMPS关于MSD计算的问题
已经有17人回复
- 求助，初学lammps求输入文件解疑~
已经有7人回复
- 分子动力学模拟中的系综问题
已经有5人回复
- 分子动力学模拟时如何利用周期性边界条件？？
已经有5人回复
- 怎么样开始LAMMPS的学习呢
已经有18人回复
- lammps求助：计算含有不同原子体系的热导率的in文件该怎么修改
已经有7人回复
- 新人求助 生物大分子分子模拟用什么软件
已经有4人回复
- 寻求lammps的应用 欢迎大家畅所欲言
已经有8人回复
- 【求助】LAMMPS-运行报错
已经有9人回复
- 【求助】lammps安装过程中，在安装fftw的过程中遇到问题
已经有8人回复
- 【求助】Lammps能做布朗动力学模拟吗？
已经有3人回复
- 【求助】LAMMPS、NAMD和CHARMM谁最适合生物大分子模拟？
已经有8人回复
- 【求助】lammps中多元化合物的晶格创建问题
已经有14人回复
- 【求助】MS建模导入lammps问题求救
已经有14人回复
- 【求助】Lammps 多机并行的问题
已经有11人回复
- 【求助】新手请教分子模拟问题
已经有27人回复
Tanya_snail
木虫 (小有名气)
- 应助: 25 (小学生)
- 金币: 3386.2
- 红花: 3
- 帖子: 298
- 在线: 333.3小时
- 虫号: 1656666
- 注册: 2012-03-01
- 性别: MM
- 专业: 金属材料的微观结构
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-11-26 11:24:56
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-11-26 11:24:56
|
在windows下也可以运行，不过好像不能做并行计算了，在windows下用DOS就可以用了，在LAMMPS Windows serial executable ,会得到一个lmp_win_no-mpi.exe,我将它放在e:\lammps下。将一个实验用的in.colloid输入文件也放在lammps下，用以测试。 开始-运行-cmd,找到可执行文件的位置，输入“e:”回车，输入“cd lammps”,然后按照手册上的说明输入“lmp_win_no-mpi -in in.colloid”就开始算了！！！！（mpi后面有个空格！） lammps的官网http://lammps.sandia.gov，里面可以下载到manual，初期还是多看看manual吧 |
2楼2013-08-20 14:16:20
hwceng0816
木虫 (著名写手)
- 应助: 130 (高中生)
- 金币: 4121
- 散金: 244
- 红花: 46
- 帖子: 1914
- 在线: 1123.9小时
- 虫号: 1529751
- 注册: 2011-12-08
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
3楼2013-08-20 15:31:26
Tanya_snail
木虫 (小有名气)
- 应助: 25 (小学生)
- 金币: 3386.2
- 红花: 3
- 帖子: 298
- 在线: 333.3小时
- 虫号: 1656666
- 注册: 2012-03-01
- 性别: MM
- 专业: 金属材料的微观结构
4楼2013-08-20 16:44:02
Bessel
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 1506.5
- 散金: 4755
- 红花: 8
- 帖子: 609
- 在线: 234.1小时
- 虫号: 370174
- 注册: 2007-05-13
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
5楼2013-08-22 16:04:33
hwceng0816
木虫 (著名写手)
- 应助: 130 (高中生)
- 金币: 4121
- 散金: 244
- 红花: 46
- 帖子: 1914
- 在线: 1123.9小时
- 虫号: 1529751
- 注册: 2011-12-08
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
6楼2013-08-22 18:54:57
奈落之夜
木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 1890.6
- 红花: 1
- 帖子: 393
- 在线: 73.9小时
- 虫号: 2550025
- 注册: 2013-07-17
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
7楼2013-11-26 10:17:21
