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herarysara

木虫 (小有名气)

[求助] 求助,初学lammps求输入文件解疑~

看了很多算例,在定义系综时,为什么总出现:
fix 1 all nve
fix 3 all nvt temp 300.0 300.0 0.01
前面定义nve对系统做nvt计算有什么用?
另外在算例的输入文件中总是找不着计算的关键命令,比如说做分子动力学或者能量最小化,应该加入什么命令,或者说这些命令在其他的执行文件中给定。求大神详解,谢谢!
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zhang_jaj

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2 2012-11-13 22:22:57
我也最近在学这个lammps,我觉得你应该把所以例子都看一遍,尤其是关于每个例子里in文件里每一行的命令代表了什么意义等。最小化就要用minize这个命令可以查mannul看怎么用。一般建好的模型都要先能量最小化一下。
2楼2012-11-13 21:42:41
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-11-14 19:38:27
3楼2012-11-13 22:23:59
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herarysara

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhang_jaj at 2012-11-13 21:42:41
我也最近在学这个lammps,我觉得你应该把所以例子都看一遍,尤其是关于每个例子里in文件里每一行的命令代表了什么意义等。最小化就要用minize这个命令可以查mannul看怎么用。一般建好的模型都要先能量最小化一下。

谢谢回复,我这两天也在啃manual,但是内容太多,看得真的头疼,又想先搞几个算例运算,这样可以一边算一边继续学习,感觉这样上手快一点,可是老有如上所说的初级问题不入门。
4楼2012-11-14 09:30:46
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herarysara

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-11-13 22:23:59
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3946850

感谢回复,受教了。可以针对我的问题再具体一点讲解吗?谢谢...
5楼2012-11-14 09:31:49
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luxujie3

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
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chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-11-14 19:38:41
herarysara: 金币+5, 有帮助 2012-11-15 11:53:25
让模拟的体系弛豫充分,与什么nvt、npt结合使得体系更快的达到所想要的平衡
6楼2012-11-14 19:03:14
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sqzhang17

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

7楼2013-04-17 23:30:59
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sikasun

木虫 (正式写手)

NVT和NVE是系综啊,看看分子动力学的书,入门的话陈正隆的不错。中文的,容易理解。
8楼2013-04-19 10:41:06
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