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hwceng0816木虫 (著名写手)
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[求助]
用lammps做分子动力学新手求助
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虫友们好，我现在开始需要用lammps这个软件做分子动力学模拟，折腾了一段时间了，还是没搞明白我现在该怎么去进行，尤其是在装软件这一点大家的说法度不一致，有的说去linux下装lammps，关键我没有linux这方面的基础，很吃力，我想在win下做计算不知道可以不可以？前期这样，后期体系大的话再去考虑linux。 那现在的问题是我该怎么去安装这个软件，在win还是在linux，（现在的硬件是几台配置比较好的台式机） 还有就是模拟这一块的模型是怎么去弄的？需要其他软件来建立模型吗。我做的是晶界的模拟，可以不可以在in文件里面直接写出模型？ 还请有经验的指导一二，不胜感激！ |
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hwceng0816
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【答案】应助回帖
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月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-11-26 11:24:56
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月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-11-26 11:24:56
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在windows下也可以运行，不过好像不能做并行计算了，在windows下用DOS就可以用了，在LAMMPS Windows serial executable ,会得到一个lmp_win_no-mpi.exe,我将它放在e:\lammps下。将一个实验用的in.colloid输入文件也放在lammps下，用以测试。 开始-运行-cmd,找到可执行文件的位置，输入“e:”回车，输入“cd lammps”,然后按照手册上的说明输入“lmp_win_no-mpi -in in.colloid”就开始算了！！！！（mpi后面有个空格！） lammps的官网http://lammps.sandia.gov，里面可以下载到manual，初期还是多看看manual吧 |
2楼2013-08-20 14:16:20
Tanya_snail
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200