24小时热门版块排行榜    

查看: 3493  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

hwceng0816

木虫 (著名写手)

[求助] 用lammps做分子动力学新手求助

虫友们好,我现在开始需要用lammps这个软件做分子动力学模拟,折腾了一段时间了,还是没搞明白我现在该怎么去进行,尤其是在装软件这一点大家的说法度不一致,有的说去linux下装lammps,关键我没有linux这方面的基础,很吃力,我想在win下做计算不知道可以不可以?前期这样,后期体系大的话再去考虑linux。
那现在的问题是我该怎么去安装这个软件,在win还是在linux,(现在的硬件是几台配置比较好的台式机)
还有就是模拟这一块的模型是怎么去弄的?需要其他软件来建立模型吗。我做的是晶界的模拟,可以不可以在in文件里面直接写出模型?
还请有经验的指导一二,不胜感激!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

奈落之夜

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-26 11:25:13
需要ms建模型,安装看官网百度都有很清楚的说明,别嫌麻烦,没有省事能做的,省事的东西也出不了好东西
7楼2013-11-26 10:17:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

Tanya_snail

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2013-11-26 11:24:56
在windows下也可以运行,不过好像不能做并行计算了,在windows下用DOS就可以用了,在LAMMPS Windows serial executable ,会得到一个lmp_win_no-mpi.exe,我将它放在e:\lammps下。将一个实验用的in.colloid输入文件也放在lammps下,用以测试。
开始-运行-cmd,找到可执行文件的位置,输入“e:”回车,输入“cd lammps”,然后按照手册上的说明输入“lmp_win_no-mpi -in in.colloid”就开始算了!!!!(mpi后面有个空格!)
lammps的官网http://lammps.sandia.gov,里面可以下载到manual,初期还是多看看manual吧
2楼2013-08-20 14:16:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hwceng0816

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Tanya_snail at 2013-08-20 14:16:20
在windows下也可以运行,不过好像不能做并行计算了,在windows下用DOS就可以用了,在LAMMPS Windows serial executable ,会得到一个lmp_win_no-mpi.exe,我将它放在e:\lammps下。将一个实验用的in.colloid输入文件也 ...

谢谢您的回复,具体的win下安装怎么弄,教程度说不清楚,我想加个您的联系方式,想咨询一下您,QQ或者email
3楼2013-08-20 15:31:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Tanya_snail

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 应助指数+1, 鼓励交流! 2013-11-26 11:25:04
引用回帖:
3楼: Originally posted by hwceng0816 at 2013-08-20 15:31:26
谢谢您的回复,具体的win下安装怎么弄,教程度说不清楚,我想加个您的联系方式,想咨询一下您,QQ或者email...

具体的就是那样啊,win下不用那么麻烦,你现在应该是下载了那个后缀名exe的可执行文件吧?然后就照我说的运行就可以了,没那么麻烦的,至于DOS怎么进去,你就去附件里有个“运行”,点开以后输入cmd就可以了
4楼2013-08-20 16:44:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[职场人生] 40+中年人失业后,还能找到好工作吗? +9 xqy2009 2026-10-13 11/550 2026-10-15 16:37 by beefly
[有机交流] 用NBS溴化时溶剂除了CCl4外还有什么 +3 18834002860 2026-10-12 6/300 2026-10-15 14:30 by 长沙摩尔信息科�
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗? 200+7 David1982 2026-10-13 11/550 2026-10-15 10:30 by zyqchem
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见