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科妍

新虫 (初入文坛)

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[交流] 求高手帮忙：autodock:对接不了哈！！

在最后一步进行AutoDock对接时，屏幕闪图一下就结束了，然后在输出的命令行里总出现“AutoDock needs the extension of the docking parameter file to be ".dpf D:/cygwin/bin/autodock4.exe:Unsuccessful Completion” 实在费解哈！求高手相助！！

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1楼 2013-08-13 16:45:28

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科妍

新虫 (初入文坛)

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引用回帖:

6楼: Originally posted by longytu at 2013-09-24 20:05:46
没有生成dpf文件把

生成了，可能就是因为前面的问题吧！现在又有新的问题了，呵呵，想设置一些柔性残基的对接，但是总跑不成功啊！

“记得这个文件中一定要有以下一行：
map hsg1_rigid.A.map # atom-specific affinity map

否则后面会报错的说没有A.map生成（这跟CA－CB间的键没有关系的）”

看见有PPT教程里写了上面这段话，可是没有map hsg1_rigid.A.map # atom-specific affinity map ，且确实报错说“sorry，I can't find or open hsg1_rigid.A ”怎么添加啊？Edit GPF里面虽然可以修改（通过read 和write 键）但是修改后又会有新的错误，譬如 not enough map keywords found 等等，
不知阁下有否高招啊！