24小时热门版块排行榜    

查看: 1342  |  回复: 3

小小佐罗2

木虫 (正式写手)

[求助] 菌株16s鉴定(系统发育树)

大家好:最近在做细菌的16s的鉴定工作,遇到很多问题,想向大家请教一下,首先我用了16s通用引物进行测序,测序结果在NCBI上进行BLAST比对,结果发现和很多菌的同源性都在99%,最后查了一些资料通过系统发育树来鉴定,于是下载了同源性>98%的标准菌株16s序列利用mega5建立系统发育树,结果没有和一种菌在同一枝上面,附图,第一次做也不知道问题出在哪里,只是想通过系统发育树找到最近的那个菌株初步确定菌株种属。还望大神指点!谢谢!
菌株16s鉴定(系统发育树)
E@}}]`6UHLVMMUQG4J5SL5B.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小佐罗2

木虫 (正式写手)

求帮助啊
2楼2013-08-13 09:04:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hkqgeoffrey

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小小佐罗2: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢你的帮助,现在做不了生化鉴定 头大 2013-08-17 20:19:13
利用MEGA估算下J113和这几种标准菌株的进化距离,有可能进化距离也相同。
从你的进化树上,我发现已经可以确定J113是乳杆菌属乳酸菌,只是亚种不同,16S的结果只能很准确的反映属的特异性,对少数种也很精确,我想你的情况用16S确定后面的不可行,你尝试做其他实验来区分这几个亚种吧,不如查资料做做生理生化区分实验,有条件最好做一下杂交看看
兴趣是第一导师,我爱它,因此我毫无疲倦的探索
3楼2013-08-13 15:42:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lilongping

新虫 (正式写手)

哈哈哈
4楼2013-08-15 11:06:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小小佐罗2 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 03:26 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 3/150 2026-08-30 02:18 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 02:09 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:58 by ZPa0EcMwuECS
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:47 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 01:34 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 01:12 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 01:03 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 00:41 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 12/600 2026-08-30 00:31 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +5 gdd2018 2026-08-28 10/500 2026-08-29 14:10 by Jacob678
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见