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lance-tan

金虫 (小有名气)

[求助] 绿藻植物基因组DNA提取

最近准备提某种藻类植物的基因组DNA,新手上路,请大家推荐下手提用哪些方法好用点?  还有一个问题,就是如何能够去除色素?
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Sthunder

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lance-tan: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-08-02 10:44:39
laozuzunzhe: 金币+4, good! 2013-08-02 11:16:49
1 取盐藻20 ml,4 000 rps离心3 min,用枪移上清,最后留约1 ml,吹匀后移到1.5 mlEP管内,4 000 rps离心5 min。
2 向沉淀中加入567 μL的TE缓冲掖,用枪吹打使其充分悬浮,加3 μL的蛋白酶K(20mg/ml,该酶在95℃,10 min才失活),30 μL 10%的SDS,37 ℃温育1 h(每15 min混匀一次)
3 加100 μL的5 M的NaCl,用枪混匀,再加80 μL CTAB/NaCl(该试剂在使用前65℃温育使融化,再在室温冷却到30℃使用),混匀,65℃温育10 min。
4 加等体积(约750μL)氯仿/异戊纯(24/1),混匀(轻摇约5 min),12 000rps离心7 min,转上清到新管中。
5 加等体积的酚/氯仿/异戊醇(25/24/1),12 000 rpm离心7 min,转上清到新管中。
6 加入0.6体积的异丙醇,轻轻混合直到DNA沉淀下来,静置5 min,12 000 rpm离心5 min,弃上清,用70%乙醇洗涤沉淀两次(12 000 rpm离心1 min)。
7弃上清,放置使乙醇干燥。重溶于30~50μL TE(加RNA酶)中,65℃温育15 min,然后放置-20℃冰箱保存。


注:
1 一般基因组DNA能比质粒放得更久,且-20℃易降解而-80℃不易降解
2 步骤2中细胞悬浮后加入SDS和PK后可以直接颠倒EP管以混匀
3 步骤2后各步骤需要温和操作,防止基因组断裂。
4 CTAB提取液: NaCl            1.4MCTAB(w/v)     2%Tris•Cl         100mMEDTA          20mM巯基乙醇        0.2%
互助互励,共奋共进!!
4楼2013-08-02 02:24:07
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ecogene_wp

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我做过小球藻细胞DNA提取,用的是超声波破碎细胞,然后用传统的酚-氯仿抽提法,效果还不错。
2楼2013-08-01 21:44:07
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lance-tan

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ecogene_wp at 2013-08-01 21:44:07
我做过小球藻细胞DNA提取,用的是超声波破碎细胞,然后用传统的酚-氯仿抽提法,效果还不错。

谢谢哈..
新手入门求各位大神指导
3楼2013-08-01 21:54:29
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lance-tan

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Sthunder at 2013-08-02 02:24:07
1 取盐藻20 ml,4 000 rps离心3 min,用枪移上清,最后留约1 ml,吹匀后移到1.5 mlEP管内,4 000 rps离心5 min。
2 向沉淀中加入567 μL的TE缓冲掖,用枪吹打使其充分悬浮,加3 μL的蛋白酶K(20mg/ml,该酶在95℃ ...

谢谢了.. 我想问最后一步不加RNA酶影响大不大?
新手入门求各位大神指导
5楼2013-08-02 10:45:18
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