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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 蛋白蛋白对接用什么软件好呢？
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 蛋白蛋白对接用什么软件好呢？

蛋白蛋白对接用什么软件好呢？ZDOCK和Rdock有没有图形界面啊？
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1楼 2013-07-22 08:23:06
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加速度123

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by longlongdlut at 2013-07-22 20:47:02
推荐用HEX对接软件，HEX对接软件可以在linux和windows下运行，简单易操作；不会用hex软件的话，可以用HEX server ，只要提供两个蛋白的pdb代码即可，对接几分钟搞定，然后用pymol分析结果

HEX server还需要连接CPU或GPU吗？我打开这个在线服务器，说Could not connect to database - the compute cluster is probably off-line。
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5楼2018-07-12 10:13:24
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笑盲虫

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
pymol: 金币+5, ★有帮助 2013-07-22 20:47:44
autodock 做对接然后用pymol做图形处理，两者结合
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用文字走路，用行动分析
2楼2013-07-22 08:38:31
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雨落天晴

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
pymol: 金币+5, ★有帮助 2013-07-22 20:47:52
GRAMM-X: http://vakser.bioinformatics.ku.edu/resources/gramm/grammx这个不错～～～
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3楼2013-07-22 16:40:21
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longlongdlut

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
pymol: 金币+40, ★★★★★最佳答案, 谢谢 2013-07-22 20:48:10
推荐用HEX对接软件，HEX对接软件可以在linux和windows下运行，简单易操作；不会用hex软件的话，可以用HEX server ，只要提供两个蛋白的pdb代码即可，对接几分钟搞定，然后用pymol分析结果
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4楼2013-07-22 20:47:02
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