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pymol

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[求助] 蛋白蛋白对接用什么软件好呢?

蛋白蛋白对接用什么软件好呢?ZDOCK和Rdock有没有图形界面啊?
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笑盲虫

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
pymol: 金币+5, 有帮助 2013-07-22 20:47:44
autodock 做对接然后用pymol做图形处理,两者结合
用文字走路,用行动分析
2楼2013-07-22 08:38:31
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雨落天晴

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
pymol: 金币+5, 有帮助 2013-07-22 20:47:52
GRAMM-X: http://vakser.bioinformatics.ku.edu/resources/gramm/grammx这个不错~~~
3楼2013-07-22 16:40:21
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longlongdlut

铜虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
pymol: 金币+40, ★★★★★最佳答案, 谢谢 2013-07-22 20:48:10
推荐用HEX对接软件,HEX对接软件可以在linux和windows下运行,简单易操作;不会用hex软件的话,可以用HEX server ,只要提供两个蛋白的pdb代码即可,对接几分钟搞定,然后用pymol分析结果
4楼2013-07-22 20:47:02
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加速度123

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by longlongdlut at 2013-07-22 20:47:02
推荐用HEX对接软件,HEX对接软件可以在linux和windows下运行,简单易操作;不会用hex软件的话,可以用HEX server ,只要提供两个蛋白的pdb代码即可,对接几分钟搞定,然后用pymol分析结果

HEX server还需要连接CPU或GPU吗?我打开这个在线服务器,说Could not connect to database - the compute cluster is probably off-line。
5楼2018-07-12 10:13:24
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