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marineman至尊木虫 (知名作家)
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转录组分析显著基因只有5个，原因何在？
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分析衣藻油脂代谢，油脂含量和生物量差别都很大，为啥转录组分析显著记忆只有五个？ 这个太离谱了。 转录组分析需要注意什么？ 只有建设性意见会给金币，灌水的抱歉。 |
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【答案】应助回帖
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137167741: 金币+2, 小木虫交流，共同进步~~ 2013-07-17 21:49:41
marineman: 金币+3, ★★★★★最佳答案, 希望继续讨论 2013-07-18 06:59:16
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你用的对照组可能不是很恰当，多数的tools 寻找差异基因基于不同对照整体转录的背景被视为是相同的，通过拟合不同曲线来判断置信区间，如果你两个sample 本身差异非常大的话，任何工具处理的时候方差太大，可信差异基因就会非常非常的少， 你可以先画个表达背景的density distribution先看看，另外在call DEG时候，是否有replication， 用的工具什么的都有很大的差别 |
2楼2013-07-17 18:46:00
marineman
至尊木虫 (知名作家)
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