| 查看: 2982 | 回复: 7 | |||
yqx1985木虫 (著名写手)
云中仙
|
[交流]
如何多配体对接多蛋白？ 已有4人参与
|
|
各位老鸟好，我没搞过分子对接，可能问题对你们来说会比较幼稚。 我现在手里有两个数据库，即配体数据库和受体数据库，我想知道： 1. 有什么软件可以对这两个库进行对接？ 即依次将配体数据库中的配体与受体数据库中的每个受体进行对接，最好是批处理的形式。 如果不能实现上面的话，一个配体与多个受体对接也行，不知这样能实现不？ 2. 我想要的对接结果是在无水环境中的，而不是溶液中的，这个可以实现不？ 我不太清楚现在的对接方法是否会有媒介环境的限制，不过我需要的是看配体与受体在无水环境下的对接效果。 |
回复此楼» 猜你喜欢
某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感
已经有10人回复
-
今天务委会开完了，明天出结果吗
已经有11人回复
-
有没有大神帮我看看基金代码
已经有9人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有23人回复
-
在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。
已经有8人回复
-
今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果
已经有22人回复
-
放榜前的不淡定
已经有18人回复
-
什么时候开奖？
已经有13人回复
-
如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》
已经有8人回复
-
没有任何消息-是不是就凉了
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何将sybyl对接后的蛋白质和配体保存成一个PDB文件
已经有8人回复
- autodock对接时蛋白的处理问题
已经有6人回复
- gromacs主页的蛋白质与配体作用
已经有5人回复
- 请教如何将下载下来的蛋白中的小分子配体删掉？
已经有13人回复
- 蛋白质、核酸、抗原、抗体、酶、配体、受体，生长因子，细胞因子等等之间的关系是什么
已经有4人回复
- 甲胎蛋白适配体
已经有3人回复
- 分子对接前，含有配体的复合蛋白怎么处理？HETATM开头的元素要删除吗
已经有9人回复
- 急问，怎么得到蛋白复合物中的蛋白和配体的结合界面
已经有8人回复
- ds做对接后怎么把配体和蛋白一起导出作为一个复合物结构
已经有3人回复
- 蛋白质和什么化学基团（配体）可以（可逆的）形成共价键
已经有11人回复
- 用autodock做对接，box设置无法包括受体活性区域和配体
已经有6人回复
- 蛋白分子建模 小分子化合物画图 酶与配体的分子模拟
已经有11人回复
- sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？
已经有12人回复
- 适配体aptamer与蛋白结合以及与互补链结合作用力哪个比较大呢？
已经有14人回复
- 配体与打分分子不能很好对接，怎么回事？
已经有8人回复
- 做分子对接前选择配体和受体时有什么要求吗？
已经有5人回复
- 【求助】分子对接后如何计算配体小分子和受体蛋白质相应残基的平面角、面心距、点面距
已经有8人回复
- 【求助】请问怎样除去蛋白质复合物上已经结合上的配体和小分子？
已经有7人回复
2楼2013-07-02 08:49:46
yqx1985
木虫 (著名写手)
云中仙
- 应助: 34 (小学生)
- 贵宾: 0.032
- 金币: 1593.8
- 散金: 1267
- 红花: 33
- 帖子: 1547
- 在线: 620.7小时
- 虫号: 550008
- 注册: 2008-04-22
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
3楼2013-07-02 09:15:51
lujunyan1118
金虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1306.9
- 帖子: 73
- 在线: 20.4小时
- 虫号: 871655
- 注册: 2009-10-14
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
4楼2013-07-02 12:06:58
yqx1985
木虫 (著名写手)
云中仙
- 应助: 34 (小学生)
- 贵宾: 0.032
- 金币: 1593.8
- 散金: 1267
- 红花: 33
- 帖子: 1547
- 在线: 620.7小时
- 虫号: 550008
- 注册: 2008-04-22
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
5楼2013-07-02 12:40:02
6楼2017-02-19 14:35:23
7楼2017-02-19 14:35:52
JIANGWENJUN
新虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1634.8
- 散金: 426
- 红花: 1
- 帖子: 523
- 在线: 24.4小时
- 虫号: 4857981
- 注册: 2016-07-21
- 性别: GG
- 专业: 中医骨伤科
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
用过sybyl做对接，曾经和你一样想两个数据库做对接，后来发现sybyl做不出来，不知道其他能不能。然后一个对多个做出来了！ 发自小木虫Android客户端 |
8楼2017-02-22 15:11:12
28