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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 如何多配体对接多蛋白？
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yqx1985

木虫 (著名写手)

云中仙

[交流] 如何多配体对接多蛋白？已有4人参与

各位老鸟好，我没搞过分子对接，可能问题对你们来说会比较幼稚。
我现在手里有两个数据库，即配体数据库和受体数据库，我想知道：
1. 有什么软件可以对这两个库进行对接？
即依次将配体数据库中的配体与受体数据库中的每个受体进行对接，最好是批处理的形式。
如果不能实现上面的话，一个配体与多个受体对接也行，不知这样能实现不？
2. 我想要的对接结果是在无水环境中的，而不是溶液中的，这个可以实现不？
我不太清楚现在的对接方法是否会有媒介环境的限制，不过我需要的是看配体与受体在无水环境下的对接效果。
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人面不知何时去，桃花依旧笑春风
1楼2013-07-01 22:04:51
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longytu

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★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-07-02 18:36:34
1:多配体与多受体对接的软件好像没听说过，可以固定受体，筛选有活性的配体，软件有DOCK，Autodock，PYRX，DS，Gold等等
2：第二个问题等高手回复，呵呵
赞一下 回复此楼
2楼2013-07-02 08:49:46
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