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动力学MSD分析
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我做的是有机小分子和金表面的相互作用，对模型结构结构优化后先用500ps NVT平衡，后用5ns的NVE动力学分析数据，得到的MSD图很难看，后来将动力学时间增加到15ns，结果仍然不好，体系见下图，求高手解惑 clip_image002.jpg  5ns NVE.jpg  15NS NVE.jpg |
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