24小时热门版块排行榜

返回列表

O天琊O

银虫 (小有名气)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 433.8
散金: 85
帖子: 206
在线: 203.9小时
虫号: 2171729
注册: 2012-12-07
性别: GG
专业: 生化分析及生物传感

[求助] 有关茎环结构DNA的问题

对于茎环结构的DNA，其Tm值是不是只针对茎结构的序列而言的？解链温度也只是针对这一部分的而言的温度么？换句话说，是不是茎环的茎区，和与该茎区序列一样的短dsDNA的Tm是相同的？

回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

茎环DNA

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

DNA分子stem-loop形成条件已经有14人回复
卟啉环结构和性质求助已经有5人回复
真核基因的转录终止位点如何获得的？已经有5人回复
DNA怎样形成发夹结构已经有18人回复
求高手看下这个DNA单链的结构错误何在？已经有13人回复
真核生物的启动子和原核生物的启动子的结构有什么区别？已经有3人回复
重叠延伸PCR设计引物已经有3人回复
玉米转基因植株的检测中遇到的问题已经有10人回复
图例请教聚合酶（Taq酶)外切和内切具体怎么起作用的，急！已经有11人回复
分子信标（茎环DNA）的稳定性已经有5人回复
基因中存在发卡结构已经有5人回复
DNA合成仪能否合成环状单链DNA 已经有6人回复
DNA双螺旋结构中的数据是不是有错误？已经有2人回复
【求助/交流】除了swiss-model还有别的预测基因蛋白三维结构的工具吗？已经有8人回复
【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构已经有12人回复

没有什么不可以

1楼 2013-06-03 19:53:37

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

回帖置顶 ( 共有1个 )

shixiaba

至尊木虫 (正式写手)

应助: 42 (小学生)
金币: 11976
散金: 100
红花: 4
帖子: 584
在线: 182.6小时
虫号: 996343
注册: 2010-04-14
性别: GG
专业: 无机纳米化学

【答案】应助回帖

amisking: 回帖置顶 2013-06-03 20:39:43

引用回帖:

3楼: Originally posted by O天琊O at 2013-06-03 20:10:41
因为要用到呀。。。倘若茎环结构DNA和其互补链完全杂交，那么该双链的Tm应该比那段该和茎区序列一样的短dsDNA的高吧？...

理论上应该是，不过我在文献中见过类似的设计，如果楼主不是非要自己重新设计的话不妨参考文献中的成熟序列啊。

赞一下

回复此楼

4楼2013-06-03 20:22:26

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

ssyyll1019

铜虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 1034
散金: 79
红花: 5
帖子: 241
在线: 144.1小时
虫号: 818956
注册: 2009-07-30
性别: GG
专业: 生物化学

Tm值肯定是不一样的，颈环结构的DNA 也可以称作分子信标，这个由于颈部互补形成的发夹结构DNA 的Tm 值有两个因素确定，一个是碱基互补产生的，另一个是由于存在环结构产生对空间结构所产生的张力；对于这种发夹结构的DNA Tm值预测是不能通过常用个的Tm值计算方法的，给你推荐一个预测这样的DNATm 值得网站，http://mfold.rna.albany.edu/?q=mfold/DNA-Folding-Form
信标中与靶DNA互补的序列的Tm值，一般是要高于互补的茎区的Tm值，
在存在靶DNA的情况下，二者的构想是可以转换的。

赞一下(2人)

回复此楼