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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 有关茎环结构DNA的问题
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O天琊O

银虫 (小有名气)

[求助] 有关茎环结构DNA的问题

对于茎环结构的DNA，其Tm值是不是只针对 茎结构的序列而言的？解链温度也只是针对这一部分的而言的温度么？换句话说，是不是茎环的茎区，和与该茎区序列一样的短dsDNA的Tm是相同的？
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没有什么不可以
1楼 2013-06-03 19:53:37
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O天琊O

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
10楼: Originally posted by ssyyll1019 at 2013-06-04 10:25:43
Tm值 肯定是不一样的，颈环结构的DNA 也可以称作分子信标，这个由于颈部互补形成的发夹结构DNA 的Tm 值有两个因素确定，一个是碱基互补产生的，另一个是由于存在环结构产生对空间结构所产生的张力；对于这种发夹结构 ...

亲，那这样的话，那么与该分子信标完全互补的后形成的dsDNA的Tm，与分子信标本身的Tm，应该不是一样对吧？还有，按照你说的，那么分子信标本身的Tm应该比与该茎区序列一样的短dsDNA的Tm低对吧？
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没有什么不可以
11楼2013-06-04 16:04:28
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shixiaba

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
个人感觉应该是吧。楼主为什么要纠结这个问题呢？
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2楼2013-06-03 19:55:41
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O天琊O

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shixiaba at 2013-06-03 19:55:41
个人感觉应该是吧。楼主为什么要纠结这个问题呢？

因为要 用到呀。。。倘若茎环结构DNA和其互补链完全杂交，那么该双链的Tm应该比那段该和茎区序列一样的短dsDNA的高吧？
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没有什么不可以
3楼2013-06-03 20:10:41
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shixiaba

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

amisking: 回帖置顶 2013-06-03 20:39:43
引用回帖:
3楼: Originally posted by O天琊O at 2013-06-03 20:10:41
因为要 用到呀。。。倘若茎环结构DNA和其互补链完全杂交，那么该双链的Tm应该比那段该和茎区序列一样的短dsDNA的高吧？...

理论上应该是，不过我在文献中见过类似的设计，如果楼主不是非要自己重新设计的话不妨参考文献中的成熟序列啊。
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4楼2013-06-03 20:22:26
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