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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 有关茎环结构DNA的问题
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O天琊O

银虫 (小有名气)

[求助] 有关茎环结构DNA的问题

对于茎环结构的DNA，其Tm值是不是只针对 茎结构的序列而言的？解链温度也只是针对这一部分的而言的温度么？换句话说，是不是茎环的茎区，和与该茎区序列一样的短dsDNA的Tm是相同的？
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没有什么不可以
1楼 2013-06-03 19:53:37
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O天琊O

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by shixiaba at 2013-06-03 21:04:59
可能是咱们的领域不是特别一样吧……我们做的只要设计合理单链是可以直接打开颈环结构然后与其杂交的，就是在室温反应。我估计楼主做的不是室温，所以涉及到了这个问题。...

那你做的首先得先保证你的茎环在那个温度下可以稳定存在呀，其实茎环和单链是处于一个动态平衡的过程的。。。。
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没有什么不可以
7楼2013-06-04 08:40:14
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shixiaba

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
个人感觉应该是吧。楼主为什么要纠结这个问题呢？
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2楼2013-06-03 19:55:41
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O天琊O

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shixiaba at 2013-06-03 19:55:41
个人感觉应该是吧。楼主为什么要纠结这个问题呢？

因为要 用到呀。。。倘若茎环结构DNA和其互补链完全杂交，那么该双链的Tm应该比那段该和茎区序列一样的短dsDNA的高吧？
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没有什么不可以
3楼2013-06-03 20:10:41
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shixiaba

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

amisking: 回帖置顶 2013-06-03 20:39:43
引用回帖:
3楼: Originally posted by O天琊O at 2013-06-03 20:10:41
因为要 用到呀。。。倘若茎环结构DNA和其互补链完全杂交，那么该双链的Tm应该比那段该和茎区序列一样的短dsDNA的高吧？...

理论上应该是，不过我在文献中见过类似的设计，如果楼主不是非要自己重新设计的话不妨参考文献中的成熟序列啊。
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4楼2013-06-03 20:22:26
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