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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 土壤真菌DGGE
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zwsclz

木虫 (著名写手)

[求助] 土壤真菌DGGE 已有1人参与

各位大侠，由于本人是刚开始做这方面工作，做出来的土壤DGGE图总觉得与文献不太一样，想请各位大侠看看，行不行。还有我做的为什么总会有特别亮的条带，总觉得不舒服，不知是不是正常。左右两个是MK
土壤真菌DGGE
4-6 ITS.JPG
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1楼 2013-06-03 10:05:21
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elbo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
听别人说DGGE不宜用于分析土壤真菌。
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5楼2013-06-05 20:29:55
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双双WC

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 学习 2013-06-05 08:18:04
图跑的挺好的啊，有亮有暗那是各种菌丰度不一样，正常
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2楼2013-06-04 10:55:35
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zwsclz

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 双双WC at 2013-06-04 10:55:35
图跑的挺好的啊，有亮有暗那是各种菌丰度不一样，正常

我想请教一下，第6和11泳道是不是不正常，相似的土样怎么跑出来的条带会差异这么大，尤其是和第16泳道基本是相同的样品。
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3楼2013-06-05 08:06:27
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双双WC

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-10-29 18:22:44
6和11是两次PCR的产物吧，从我自己做的情况看DGGE的重复性确实不是很好。基本相同的样品？是相同还是不同，有的时候相同样品做，做到相对稳定的图就行
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4楼2013-06-05 19:49:17
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