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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 土壤真菌DGGE
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zwsclz

木虫 (著名写手)

[求助] 土壤真菌DGGE 已有1人参与

各位大侠，由于本人是刚开始做这方面工作，做出来的土壤DGGE图总觉得与文献不太一样，想请各位大侠看看，行不行。还有我做的为什么总会有特别亮的条带，总觉得不舒服，不知是不是正常。左右两个是MK
土壤真菌DGGE
4-6 ITS.JPG
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1楼 2013-06-03 10:05:21
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双双WC

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 学习 2013-06-05 08:18:04
图跑的挺好的啊，有亮有暗那是各种菌丰度不一样，正常
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2楼2013-06-04 10:55:35
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zwsclz

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 双双WC at 2013-06-04 10:55:35
图跑的挺好的啊，有亮有暗那是各种菌丰度不一样，正常

我想请教一下，第6和11泳道是不是不正常，相似的土样怎么跑出来的条带会差异这么大，尤其是和第16泳道基本是相同的样品。
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3楼2013-06-05 08:06:27
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双双WC

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-10-29 18:22:44
6和11是两次PCR的产物吧，从我自己做的情况看DGGE的重复性确实不是很好。基本相同的样品？是相同还是不同，有的时候相同样品做，做到相对稳定的图就行
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4楼2013-06-05 19:49:17
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elbo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
听别人说DGGE不宜用于分析土壤真菌。
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5楼2013-06-05 20:29:55
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落寞飞雪

新虫 (初入文坛)
做的挺好的呀，我现在也做土壤的真菌PCR-DGGE，能发一下你的方法吗？我的E-mail:a2012jiayou@126.com,谢谢了。
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活着不易，但知道珍惜的却寥寥无几
6楼2013-10-22 22:18:33
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暖如夏天

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
7楼2014-10-23 12:05:16
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shanshan柳

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 暖如夏天 at 2014-10-23 12:05:16
楼主你好，我现在做的也是土壤真菌，很烦条带分不开，怎么回事呢？你的胶浓度和梯度是多少呢，电压和时间呢

同学，我们真菌做了快一个月了，还是跑不开，不知道你们现在解决问题了没？
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8楼2015-12-14 13:05:35
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崔士元

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 落寞飞雪 at 2013-10-22 22:18:33
做的挺好的呀，我现在也做土壤的真菌PCR-DGGE，能发一下你的方法吗？我的E-mail:a2012jiayou@126.com,谢谢了。

直接利用高通量测序做微生物多样性分析嘛

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男人，就要对自己狠一点！
9楼2015-12-23 11:07:56
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崔士元

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by shanshan柳 at 2015-12-14 13:05:35
同学，我们真菌做了快一个月了，还是跑不开，不知道你们现在解决问题了没？...

直接用高通量测序做微生物多样性分析，很方便

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男人，就要对自己狠一点！
10楼2015-12-23 11:08:35
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