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zwsclz

木虫 (著名写手)

[求助] 土壤真菌DGGE 已有1人参与

各位大侠,由于本人是刚开始做这方面工作,做出来的土壤DGGE图总觉得与文献不太一样,想请各位大侠看看,行不行。还有我做的为什么总会有特别亮的条带,总觉得不舒服,不知是不是正常。左右两个是MK
土壤真菌DGGE
4-6 ITS.JPG
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双双WC

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 学习 2013-06-05 08:18:04
图跑的挺好的啊,有亮有暗那是各种菌丰度不一样,正常
2楼2013-06-04 10:55:35
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zwsclz

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 双双WC at 2013-06-04 10:55:35
图跑的挺好的啊,有亮有暗那是各种菌丰度不一样,正常

我想请教一下,第6和11泳道是不是不正常,相似的土样怎么跑出来的条带会差异这么大,尤其是和第16泳道基本是相同的样品。
3楼2013-06-05 08:06:27
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双双WC

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-10-29 18:22:44
6和11是两次PCR的产物吧,从我自己做的情况看DGGE的重复性确实不是很好。基本相同的样品?是相同还是不同,有的时候相同样品做,做到相对稳定的图就行
4楼2013-06-05 19:49:17
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elbo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
听别人说DGGE不宜用于分析土壤真菌。
5楼2013-06-05 20:29:55
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落寞飞雪

新虫 (初入文坛)

做的挺好的呀,我现在也做土壤的真菌PCR-DGGE,能发一下你的方法吗?我的E-mail:a2012jiayou@126.com,谢谢了。
活着不易,但知道珍惜的却寥寥无几
6楼2013-10-22 22:18:33
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暖如夏天

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

7楼2014-10-23 12:05:16
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shanshan柳

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 暖如夏天 at 2014-10-23 12:05:16
楼主你好,我现在做的也是土壤真菌,很烦条带分不开,怎么回事呢?你的胶浓度和梯度是多少呢,电压和时间呢

同学,我们真菌做了快一个月了,还是跑不开,不知道你们现在解决问题了没?
8楼2015-12-14 13:05:35
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崔士元

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 落寞飞雪 at 2013-10-22 22:18:33
做的挺好的呀,我现在也做土壤的真菌PCR-DGGE,能发一下你的方法吗?我的E-mail:a2012jiayou@126.com,谢谢了。

直接利用高通量测序做微生物多样性分析嘛

发自小木虫IOS客户端
男人,就要对自己狠一点!
9楼2015-12-23 11:07:56
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崔士元

金虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by shanshan柳 at 2015-12-14 13:05:35
同学,我们真菌做了快一个月了,还是跑不开,不知道你们现在解决问题了没?...

直接用高通量测序做微生物多样性分析,很方便

发自小木虫IOS客户端
男人,就要对自己狠一点!
10楼2015-12-23 11:08:35
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