| 查看: 3110 | 回复: 5 | |||
[求助]
测序结果已出，后续如何分析，以达到菌种鉴定的目的
|
| 测序结果已出，后续如何分析，以达到菌种鉴定的目的，要具体的步骤，十分感谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
收到复试调剂但是去不了
已经有7人回复
-
260求调剂
已经有5人回复
-
急需调剂
已经有10人回复
-
申博/考博
已经有4人回复
-
化工学硕294分，求导师收留
已经有37人回复
-
求调剂
已经有11人回复
-
一志愿华中农业071010，320求调剂
已经有19人回复
-
304求调剂
已经有7人回复
-
求博导｜生物质基多孔碳/超级电容方向，已有相关成果，寻能源材料/碳材料方向老师
已经有3人回复
-
二苯甲酮酸类衍生物
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 不同来源的同种细菌血缘关系的鉴定
已经有5人回复
- 急！PCR产物测序找不到引物
已经有17人回复
- 微生物生理生化鉴定准确性
已经有11人回复
- 质粒鉴定是送菌种，还是送已经提好了的质粒好
已经有12人回复
- 分离出来的病原菌该如何鉴定到属?
已经有5人回复
- 16SDNA-PCR产物测序结果拿到后该如何处理？
已经有5人回复
- 发个小文章求毕业，关于菌种鉴定的
已经有7人回复
- 菌种鉴定的问题
已经有10人回复
- 菌种鉴定除了做相关生理生化实验，有木有简单点的方法？
已经有12人回复
- 我去做菌种鉴定16S RNA 测出来5条 片段……请问这是怎么回事？
已经有4人回复
- 用PCR扩增后的DNA如何测序？不能直接用PCR就知道是什么菌种之类的吧？
已经有6人回复
- 菌种生理生化特性
已经有3人回复
- 细菌鉴定--blast后一定要再到Genbank中检索才能确定什么菌，得到accession number吗？
已经有12人回复
- PCR是阳性但酶切是阴性，怎么回事？
已经有10人回复
- 【求助/交流】哪里可以做细菌菌种鉴定？
已经有16人回复
- 【求助/交流】关于16srRNA菌种鉴定问题
已经有14人回复
志子
至尊木虫 (文坛精英)
- MicEPI: 5
- 应助: 2847 (讲师)
- 贵宾: 0.743
- 金币: 42456.9
- 散金: 3857
- 红花: 299
- 帖子: 21362
- 在线: 1136.8小时
- 虫号: 2471022
- 注册: 2013-05-19
- 专业: 高分子组装与超分子结构
2楼2013-05-19 23:56:42
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
对于临床菌株，美国CLSI组织的文件MM-18A《DNA靶基因序列鉴定细菌和真菌的解释标准；批准指南》详细介绍了广谱基因测序技术（broad-range gene sequencing）在细菌与真菌鉴定中的应用，其中综合了细菌的生化反应、rRNA靶基因与其他靶基因序列分析的方法， 表1、16S rRNA基因序列鉴定细菌的通用解释标准 相似度 序列的类型 相似度差是否大于0.8% 结果报告 评述 ≥99.0% 模式菌株 是 属名和种名 ≥99.0% 模式菌株 否（与他多个种的相似度差小于0.8%） 属名和多个种名 低鉴定度的鉴定 97.0-98.9% 模式菌株或 有效命名的菌株 能与其他属区分 属 需注明“亲缘关系最近的菌种” 95.0-96.9 模式菌株或 有效命名的菌株 可能的新属新种，并注明“亲缘关系最近的菌属” < 95% 模式菌株或 有效命名的菌株 可能的新属新种 注：分枝杆菌与放线菌除外 |
3楼2013-05-20 01:34:17
20093651
铁杆木虫 (职业作家)
- MicEPI: 2
- 应助: 212 (大学生)
- 金币: 5307.4
- 散金: 3276
- 红花: 63
- 沙发: 2
- 帖子: 3731
- 在线: 656.6小时
- 虫号: 1176129
- 注册: 2010-12-23
- 专业: 金属材料表面科学与工程
4楼2013-05-20 16:13:09
carrieskl
木虫 (著名写手)
- MicEPI: 1
- 应助: 31 (小学生)
- 金币: 3156.3
- 散金: 3
- 红花: 11
- 帖子: 1037
- 在线: 104.9小时
- 虫号: 1541324
- 注册: 2011-12-17
- 性别: MM
- 专业: 非感染性皮肤病
5楼2013-05-20 17:35:55
6楼2015-09-25 14:58:39
