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测序结果已出，后续如何分析，以达到菌种鉴定的目的
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| 测序结果已出，后续如何分析，以达到菌种鉴定的目的，要具体的步骤，十分感谢！ |
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志子
至尊木虫 (文坛精英)
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2楼2013-05-19 23:56:42
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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对于临床菌株，美国CLSI组织的文件MM-18A《DNA靶基因序列鉴定细菌和真菌的解释标准；批准指南》详细介绍了广谱基因测序技术（broad-range gene sequencing）在细菌与真菌鉴定中的应用，其中综合了细菌的生化反应、rRNA靶基因与其他靶基因序列分析的方法， 表1、16S rRNA基因序列鉴定细菌的通用解释标准 相似度 序列的类型 相似度差是否大于0.8% 结果报告 评述 ≥99.0% 模式菌株 是 属名和种名 ≥99.0% 模式菌株 否（与他多个种的相似度差小于0.8%） 属名和多个种名 低鉴定度的鉴定 97.0-98.9% 模式菌株或 有效命名的菌株 能与其他属区分 属 需注明“亲缘关系最近的菌种” 95.0-96.9 模式菌株或 有效命名的菌株 可能的新属新种，并注明“亲缘关系最近的菌属” < 95% 模式菌株或 有效命名的菌株 可能的新属新种 注：分枝杆菌与放线菌除外 |
3楼2013-05-20 01:34:17
20093651
铁杆木虫 (职业作家)
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4楼2013-05-20 16:13:09
carrieskl
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- 性别: MM
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5楼2013-05-20 17:35:55
6楼2015-09-25 14:58:39
50