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含羞草liu

新虫 (小有名气)

[求助] 如何去除RNA提取过程中的蛋白质污染

大家好!我目前正在构建cDNA文库,需要高质量的RNA。提取的材料是杨树叶片,最先我是用Trizol 提取的,提取到的RNA对OD值检测,发现OD260/OD280的范围在1.8~2.0之间,但电泳检测时加样孔总会发亮,也就是会有蛋白质的污染,直接用此法提取的RNA构建文库时总是很不理想。后来,我在takara 购买了RNAiso 试剂配合Fruit-mate试剂进行提取(这两种试剂是针对多糖多酚植物材料的),提取后检测,OD260/OD280的范围在1.8~2.0之间,但电泳时加样孔也会发亮,此法也不能有效的去除蛋白质。之后,我对Trizol提取后的RNA进行LiCL沉淀,配制5M LiCL沉淀液(配制方法为:称取LiCL 42.4g,Tris 0.4846g,EDTA 0.5846g溶于150ml DEPC处理水中,用5N NaOH 高PH 为7.4,之后DEPC处理水定容到200ml,高压灭菌),等量加入提取后的RNA中,-80度静置两小时,拿出后4度,14000rpm离心20min, 弃上清,可看到半透明状的沉淀。用预冷的75%乙醇清洗沉淀一次,7500rpm 离心5min,发现沉淀变成乳白色,加DEPC处理水,发现此沉淀很难溶解(已室温静置约10min,不溶,进行漩涡振荡,也不溶),随后,直接用此未完全溶解的RNA提取样进行检测,发现OD260/OD280大于1.8,有的甚至在2.0以上 ,但制胶电泳检测,加样孔仍会发亮,蛋白质仍旧没有除尽。

对于此文库构建,我已进行半年多,仍旧没有进展,问题总是出现在RNA的提取上。究竟要怎样才能除尽RNA中的蛋白质呢?请高手帮忙,感激不尽!!!
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努力,奋斗,拼搏。。。
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
试试增加酚氯仿抽提次数。每次抽提尽量充分混匀。
4楼2013-05-16 12:21:21
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德国工兵铲

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
个人建议吸取上清的时候小心点,吸取少点。
2楼2013-05-16 10:09:21
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含羞草liu

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 德国工兵铲 at 2013-05-16 10:09:21
个人建议吸取上清的时候小心点,吸取少点。

Trizol 提取时,我在吸取上清时已经很小心了,而且加氯仿分层两次,仍避免不了蛋白的污染。。。
努力,奋斗,拼搏。。。
3楼2013-05-16 10:33:45
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含羞草liu

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-05-16 12:21:21
试试增加酚氯仿抽提次数。每次抽提尽量充分混匀。

我有增回抽提的次数,但还是会有少许的蛋白污染。
努力,奋斗,拼搏。。。
5楼2013-05-16 14:04:57
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