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蛋白之家

新虫 (小有名气)

[求助] 关于原核表达结果的分析及原因

做了4个基因的原核表达  蛋白表达图
图中1,2 为空载体pET28a(+),3,4 为一个基因,5,6为第二个基因,7,8为第三个基因,9,10为第四个基因
     1,3,5,7,9为未诱导的蛋白表达情况条带,2,4,6,8,10为用IPTG诱导5h后的蛋白表达情况条带
     1,2诱导前后没有变化;泳道4为诱导后的第一个基因,较泳道3有明显变化,且大小与预测的蛋白大小一致;泳道6为诱导后的第二个基因,较泳道5也有差异,且大小与预测的蛋白大小一致;
      但泳道8为诱导后的第三个基因,较泳道7有两处明显差异,其中一个为与预测大小一致的,但另外一个不知道是什么原因造成的。泳道10为诱导后的第四个基因,较泳道9有三处明显差异,其中一个为与预测大小一致的,另外两个不知道是什么,请大家帮忙分析一下。
麻烦大家帮忙分析一下原因,谢谢!

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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
赞一下楼主的详细描述!
分子量较小的, 多出的蛋白可能是一部分大量表达出的目标蛋白降解造成的. 其实这个阶段楼主不必太在意这些多出的条带, 因为你接下来应该会做蛋白纯化吧? 纯化完了再跑个胶说不定多余的条带就消失了.
2楼2013-05-15 20:29:53
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你做一个WESTERN Blotting,就可以说明结果了!
用可以显色6个His标签的抗体,如果western blotting的结果显示8泳道和10泳道的蛋白条带>=2条,说明你的蛋白降解了!这只能说明你的蛋白稳定性较差!

如果western结果显示只有一条带!!!那你管他几条带,方正我还要过NI柱纯化,只有我的目的蛋白能挂上,其他的又挂不上!他可能是宿主菌的非特异性条带!第10泳道最上面最粗的那条带可能就是非特异性条带,你的诱导条件可能满足了他的表达,所以表达量就大了!!你可以参照前面泳道,都有这条带的!!


希望能给你点帮助!!
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
3楼2013-05-15 20:43:38
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niushuaiji

金虫 (正式写手)

不放弃的小鸟

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
western blot,是不是目的片段降解产物就可以看出了,应该都会有非目的诱导条带的出现
Tobeornottobe,that'saproblem
4楼2013-05-16 10:34:04
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蛋白之家

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by niushuaiji at 2013-05-16 10:34:04
western blot,是不是目的片段降解产物就可以看出了,应该都会有非目的诱导条带的出现

我没有再做western blot  就做到原核表达这里就停止了   所以现在想知道出现非特异性目的条带的原因
5楼2013-05-16 10:54:02
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蛋白之家

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 不转录的DNA at 2013-05-15 20:43:38
你做一个WESTERN Blotting,就可以说明结果了!
用可以显色6个His标签的抗体,如果western blotting的结果显示8泳道和10泳道的蛋白条带>=2条,说明你的蛋白降解了!这只能说明你的蛋白稳定性较差!

如果weste ...

我的试验就到这里就结束了  因为没有人指导 所以自己折腾到这里就停下了  算是硕士试验结束   现在就是想知道多出来的原因   好在答辩时不被挂在台上下不来
6楼2013-05-16 11:17:50
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蛋白之家

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-05-15 20:29:53
赞一下楼主的详细描述!
分子量较小的, 多出的蛋白可能是一部分大量表达出的目标蛋白降解造成的. 其实这个阶段楼主不必太在意这些多出的条带, 因为你接下来应该会做蛋白纯化吧? 纯化完了再跑个胶说不定多余的条带就 ...

试验到这里就结束了  
所以疑问比较多
谢谢
7楼2013-05-16 11:19:18
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 蛋白之家 at 2013-05-16 11:17:50
我的试验就到这里就结束了  因为没有人指导 所以自己折腾到这里就停下了  算是硕士试验结束   现在就是想知道多出来的原因   好在答辩时不被挂在台上下不来...

楼主!我问你:假如你答辩的时候,教授问你:那几条带是什么?

你说:是非特异性条带!

教授:你怎么知道他是非特异性条带?做过验证吗?

你说:没有,是在小木虫上大家都这么说的!

教授:我还说这是你蛋白降解了呢!!!

请问你怎么回答!!!!!!!!!你可能还是被挂在台子上!!!!

做学术,要懂得严谨性!!不能确定的问题!你就需要验证!学术界没有验证,你就没有发言权!!!
我劝你还是做个western blotting!

良言!!希望能采纳······
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
8楼2013-05-16 11:29:11
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26264716

铁虫 (小有名气)

做个原核诱导就完了。。。。硕士就毕业了。。。我了个去啊。。太幸福了嘛。。
苦,才是人生
9楼2013-05-16 12:24:39
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

可能我说的话有点过了!希望你能谅解!
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
10楼2013-05-16 18:16:38
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