| 查看: 1307 | 回复: 2 | ||
[求助]
PDB文件拆分
|
| 请问一个复合蛋白质（蛋白质结合）PDB文件，怎么拆分成单个蛋白质的PDB文件？直接删除不需要蛋白质的序列跟坐标吗？ |
回复此楼» 猜你喜欢
07化学280分求调剂
已经有3人回复
-
考研化学308分求调剂
已经有8人回复
-
070300化学求调剂
已经有7人回复
-
生物学一志愿985，分数349求调剂
已经有9人回复
-
341求调剂(一志愿湖南大学070300)
已经有4人回复
-
336化工调剂
已经有5人回复
-
279分求调剂 一志愿211
已经有17人回复
-
291求调剂
已经有4人回复
-
328求调剂，英语六级551，有科研经历
已经有12人回复
-
一志愿上海交大生物与医药专硕324分，求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Pymol分析对接后的pdb文件
已经有6人回复
- 请教各位有关分子对接的问题
已经有5人回复
- PDB文件预处理
已经有12人回复
- vmd做pdb格式文件的动画求助
已经有12人回复
- gromacs，用pdb文件生成top文件时遇到的问题
已经有4人回复
- 下载了一份PDB文件，用什么软件打开？
已经有12人回复
- 把一个pdb的蛋白质复合物 保存成prmtop 和inpcrd 文件
已经有3人回复
- 如何从下载的PDB文件中提取酶的活性中心
已经有6人回复
- 如何制作简单的化学分子的pdb文件
已经有11人回复
- pdb文件，top文件
已经有6人回复
- pdb文件的处理
已经有5人回复
- pdb文件中加入氢原子
已经有7人回复
- PDB上下载了后缀为.pdb的文件后怎么打开看啊？是不是三维图下都会有文字介绍啊？
已经有6人回复
- 获得pdb文件的源文件
已经有3人回复
- 【求助】如何合并文件 pdb psf
已经有4人回复
- 【求助】pdb文件转换成gjf文件问题
已经有4人回复
- 【原创】分子对接，同源模建，分子动力学软件介绍帖
已经有35人回复
- 【求助】用于ligplot的pdb文件究竟应如何准备?
已经有3人回复
- 【讨论】怎么样拆分pdf格式文件或将其变为文档形式
已经有6人回复
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
harrymao: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 我用perl程序拆分 原来很简单 2013-05-15 17:28:23
感谢参与，应助指数 +1
harrymao: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 我用perl程序拆分 原来很简单 2013-05-15 17:28:23
|
1、直接删除不需要蛋白质的序列跟坐标，可行！ 2、用VMD 命令，你需要知道你要选择的蛋白质，比如说 resid 10-25 则： set sel [atomselect top "resid >=10 and resid <=25"] $sel writepdb protein_ok.pdb 这样就把你选择的蛋白质保存在了 protein_ok.pdb 里。 在vmd中这句 set sel [atomselect top "resid >=10 and resid <=25"] 可以根据你自己的需求，有好多种选择的办法 |
2楼2013-05-15 14:51:57
xulinan
木虫 (小有名气)
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 2564.9
- 散金: 3
- 帖子: 145
- 在线: 96.3小时
- 虫号: 1123245
- 注册: 2010-10-15
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
3楼2013-05-15 14:54:20
