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re-member

金虫 (小有名气)

[求助] 分子模拟问题


ms做氩的扩散系数分子动力学模拟,初始FCC面心立方,864个氩原子,构建了超晶胞,这个还需要能量最小化吗?然后力场该怎么选择,之前我用的是universal,不知道对不对。
我装的ms里discover模块中没有analysis那一项,那我可以先用discover运行后再用forcite来运行analysis计算均方位移吗?
我之前用forcite跑分子动力学,感觉那些分子基本在原地晃动似的,而且还会跑出盒子,谁知道这是为什么啊?怎么解决啊?
求大神不吝赐教!
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阡陌蔓

木虫 (正式写手)

请问问题解决了吗?我发现我的dicover也没有analysis
厚重的品德,优雅的生活,唯美的爱情,一生追逐!
2楼2014-06-16 10:45:52
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说好de

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 阡陌蔓 at 2014-06-16 10:45:52
请问问题解决了吗?我发现我的dicover也没有analysis

可以用forcite中analysis分析MSD,计算扩散系数

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

加油好姑娘!
3楼2015-09-09 18:58:17
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阡陌蔓

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 说好de at 2015-09-09 21:58:17
可以用forcite中analysis分析MSD,计算扩散系数...

非常感谢
厚重的品德,优雅的生活,唯美的爱情,一生追逐!
4楼2015-09-11 21:10:55
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