24小时热门版块排行榜    

查看: 550  |  回复: 0

schalke

至尊木虫 (著名写手)

[求助] gromacs无法并行安装出错

系统为RHEL5.1,解压三个openmpi-1.6.3,fftw-3.3.3,gromacs-4.5.5
1. openmpi按照./configure->make->make install默认安装
然后在/home/.bashrc中添加export PATH=$PATH:/home/openmpi/bin并source
2. fftw直接安装双精度并行版本:./configure --prefix=/home/fftw --enable-mpi --enable-shared->
make-> make install->make distclean
然后在/home/.bashrc中添加 export CPPFLAGS=-I/home/fftw/include
export LDFLAGS=-L/home/fftw/lib并source
3.gromacs直接安装双精度并行版本:./configure --prefix=/home/gromacs --enable-mpi --disable-float --program-suffix=_mpid
到这一步出现错误
checking size of off_t... configure: error: in `/home/gromacs-4.5.5': configure: error: cannot compute sizeof (off_t)
我尝试将--enable-mpi取消就不会出错,但也无法进行并行安装了。

请教各位大侠,如何解决此问题?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

相关版块跳转 我要订阅楼主 schalke 的主题更新
信息提示
请填处理意见