| 查看: 553 | 回复: 0 | ||
schalke至尊木虫 (著名写手)
|
[求助]
gromacs无法并行安装出错
|
|
系统为RHEL5.1，解压三个openmpi-1.6.3，fftw-3.3.3，gromacs-4.5.5 1. openmpi按照./configure->make->make install默认安装 然后在/home/.bashrc中添加export PATH=$PATH:/home/openmpi/bin并source 2. fftw直接安装双精度并行版本：./configure --prefix=/home/fftw --enable-mpi --enable-shared-> make-> make install->make distclean 然后在/home/.bashrc中添加 export CPPFLAGS=-I/home/fftw/include export LDFLAGS=-L/home/fftw/lib并source 3.gromacs直接安装双精度并行版本：./configure --prefix=/home/gromacs --enable-mpi --disable-float --program-suffix=_mpid 到这一步出现错误 checking size of off_t... configure: error: in `/home/gromacs-4.5.5': configure: error: cannot compute sizeof (off_t) 我尝试将--enable-mpi取消就不会出错，但也无法进行并行安装了。 请教各位大侠，如何解决此问题？ |
回复此楼» 猜你喜欢
遇见不省心的家人很难过
已经有20人回复
-
有70后还继续奋斗在职场上的吗？
已经有4人回复
-
退学或坚持读
已经有25人回复
-
博士延得我，科研能力直往上蹿
已经有4人回复
-
面上基金申报没有其他的参与者成吗
已经有4人回复
-
多组分精馏求助
已经有6人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了?
已经有7人回复
- vasp 集群并行出错
已经有7人回复
- VASP并行计算出错
已经有9人回复
- 在gromacs中运行mdrun命令时出错
已经有10人回复
- gromacs 运行pdb2gmx中出错，pdb2gmx: error while loading shared libraries
已经有3人回复
- vasp并行测试时出错。
已经有7人回复
- cp2k并行编译出错
已经有3人回复
- CASTEP计算出错，好像是并行出了问题，请大家帮我看一下
已经有7人回复
- vasp并行出错，急于求助！！！
已经有13人回复
- vasp 并行运算出错
已经有7人回复
- vasp 并行运算出错
已经有8人回复
- gromacs 4.5.4并行安装
已经有8人回复
- fluent 单机并行计算出错
已经有5人回复
- Gromacs做steep之后做cg出错
已经有5人回复
- gromacs做全原子模拟时候，突然到MD这一步出错
已经有6人回复
- 【讨论】gromacs 并行 mpirun
已经有4人回复
- 【求助】MS5.0并行安装出错了
已经有5人回复
- 【求助】mkl+ifort+openmpi+siesta3.并行安装出错
已经有8人回复
- 【求助】请问gromacs并行命令
已经有4人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人