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schalke至尊木虫 (著名写手)
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[求助]
gromacs无法并行安装出错
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系统为RHEL5.1,解压三个openmpi-1.6.3,fftw-3.3.3,gromacs-4.5.5 1. openmpi按照./configure->make->make install默认安装 然后在/home/.bashrc中添加export PATH=$PATH:/home/openmpi/bin并source 2. fftw直接安装双精度并行版本:./configure --prefix=/home/fftw --enable-mpi --enable-shared-> make-> make install->make distclean 然后在/home/.bashrc中添加 export CPPFLAGS=-I/home/fftw/include export LDFLAGS=-L/home/fftw/lib并source 3.gromacs直接安装双精度并行版本:./configure --prefix=/home/gromacs --enable-mpi --disable-float --program-suffix=_mpid 到这一步出现错误 checking size of off_t... configure: error: in `/home/gromacs-4.5.5': configure: error: cannot compute sizeof (off_t) 我尝试将--enable-mpi取消就不会出错,但也无法进行并行安装了。 请教各位大侠,如何解决此问题? |
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