| 查看: 564 | 回复: 0 | ||
schalke至尊木虫 (著名写手)
|
[求助]
gromacs无法并行安装出错
|
|
系统为RHEL5.1，解压三个openmpi-1.6.3，fftw-3.3.3，gromacs-4.5.5 1. openmpi按照./configure->make->make install默认安装 然后在/home/.bashrc中添加export PATH=$PATH:/home/openmpi/bin并source 2. fftw直接安装双精度并行版本：./configure --prefix=/home/fftw --enable-mpi --enable-shared-> make-> make install->make distclean 然后在/home/.bashrc中添加 export CPPFLAGS=-I/home/fftw/include export LDFLAGS=-L/home/fftw/lib并source 3.gromacs直接安装双精度并行版本：./configure --prefix=/home/gromacs --enable-mpi --disable-float --program-suffix=_mpid 到这一步出现错误 checking size of off_t... configure: error: in `/home/gromacs-4.5.5': configure: error: cannot compute sizeof (off_t) 我尝试将--enable-mpi取消就不会出错，但也无法进行并行安装了。 请教各位大侠，如何解决此问题？ |
回复此楼» 猜你喜欢
什么是人一生最重要的？
已经有7人回复
-
版面费该交吗
已经有17人回复
-
体制内长辈说体制内绝大部分一辈子在底层，如同你们一样大部分普通教师忙且收入低
已经有19人回复
-
【博士招生】太原理工大学2026化工博士
已经有8人回复
-
280求调剂
已经有4人回复
-
面上可以超过30页吧？
已经有12人回复
-
为什么中国大学工科教授们水了那么多所谓的顶会顶刊，但还是做不出宇树机器人？
已经有11人回复
-
网上报道青年教师午睡中猝死、熬夜猝死的越来越多，主要哪些原因引起的？
已经有9人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了?
已经有7人回复
- vasp 集群并行出错
已经有7人回复
- VASP并行计算出错
已经有9人回复
- 在gromacs中运行mdrun命令时出错
已经有10人回复
- gromacs 运行pdb2gmx中出错，pdb2gmx: error while loading shared libraries
已经有3人回复
- vasp并行测试时出错。
已经有7人回复
- cp2k并行编译出错
已经有3人回复
- CASTEP计算出错，好像是并行出了问题，请大家帮我看一下
已经有7人回复
- vasp并行出错，急于求助！！！
已经有13人回复
- vasp 并行运算出错
已经有7人回复
- vasp 并行运算出错
已经有8人回复
- gromacs 4.5.4并行安装
已经有8人回复
- fluent 单机并行计算出错
已经有5人回复
- Gromacs做steep之后做cg出错
已经有5人回复
- gromacs做全原子模拟时候，突然到MD这一步出错
已经有6人回复
- 【讨论】gromacs 并行 mpirun
已经有4人回复
- 【求助】MS5.0并行安装出错了
已经有5人回复
- 【求助】mkl+ifort+openmpi+siesta3.并行安装出错
已经有8人回复
- 【求助】请问gromacs并行命令
已经有4人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人