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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

[求助] 求助DNA片段扩增测序结果如何比对？

扩增的基因片段连接了T载体后，菌液测序结果与原基因的CDS区如何进行比对？我直接用DNAMAN比对好像不对，同源性仅30%多啊。急求高手解答！
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1楼 2012-12-14 14:57:50
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你应该确定测序结果两端是否包括了测不准的几十个bp (看峰图)；然后去载体（web-based,NCBI）；再把去载体后的序列去blast（web-based,NCBI），看看结果就大体清楚你的克隆是否成功了。需要做个图啥的，可以再用你的DNAMAN吧
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2楼2012-12-14 17:21:38
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