应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 去除重复序列的方法
71/1返回列表
查看: 3238  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

生物蚂蚁

新虫 (初入文坛)

[求助] 去除重复序列的方法

各位，好！
    请问有什么软件可以去除众多序列中的重复序列？我分析的序列较多，大约有5万条以上，不过，我不会perl语言，最好是生物学方面的软件。谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-11-26 20:58:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liaoshibo

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有这种数据库的。你输入条件后，可以自动给你设计出序列。上过这种课，但忘了是哪个数据库。
赞一下 回复此楼
我就是我，你也是你。勿模仿，自超越。
2楼2012-11-26 21:23:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
生物蚂蚁: 金币+1, ★★★★★最佳答案 2012-12-29 17:33:11
你这个重复序列是怎么定义的。
我举个例子，两条序列A和B，A长1000bp，B长2000bp，A和B的前一半一模一样，这算重复序列不？
再比如，A和B都是1000bp，但是中间有2个bp是不同的，这样算不算呢？
赞一下 回复此楼
3楼2012-11-27 08:44:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seanzhu1996

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这种软件好像没有，至少没有免费的，可以问问测序公司，
赞一下 回复此楼
享受每天的生活
4楼2012-11-27 10:19:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

生物蚂蚁

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-11-27 08:44:13
你这个重复序列是怎么定义的。
我举个例子，两条序列A和B，A长1000bp，B长2000bp，A和B的前一半一模一样，这算重复序列不？
再比如，A和B都是1000bp，但是中间有2个bp是不同的，这样算不算呢？

是这样的：A和B长度一样，序列是一样的，简单说就是A=B。
赞一下 回复此楼
5楼2012-11-27 13:37:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 生物蚂蚁 at 2012-11-27 13:37:51
是这样的：A和B长度一样，序列是一样的，简单说就是A=B。...

那倒是让问题更简单了。
但是怀疑windows下木有这样的软件，数据量太大。还是应该在linux下处理一下。你可以压缩一下数据，然后传我，我给你处理一下。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2012-11-28 09:08:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

生物蚂蚁

新虫 (初入文坛)
内容已删除
回复此楼
7楼2012-11-28 11:13:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 生物蚂蚁 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +6 德尚中行 2026-08-27 7/350 2026-08-30 12:53 by Bxndjjd
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 11:52 by l0VvVHGBGRLv
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:41 by l0VvVHGBGRLv
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:19 by l0VvVHGBGRLv
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:17 by ZPa0EcMwuECS
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 06:57 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 06:55 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 10/500 2026-08-30 06:11 by ZPa0EcMwuECS
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 05:48 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 基金不中，共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭