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土壤微生物DNA提取不出来,是什么原因?
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three姚
银虫
(小有名气)
应助: 5
(幼儿园)
金币: 622.8
散金: 20
帖子: 99
在线: 77.1小时
虫号: 1026959
注册: 2010-05-23
性别:
MM
专业: 污染生态学
[
求助
]
土壤微生物DNA提取不出来,是什么原因?
已有3人参与
本人生态学专业,分子方面略懂皮毛。用上海生工的土壤DNA提取试剂盒从土样中提DNA,按照说明书操作,前后提了四次,0.8%琼脂糖凝胶电泳,什么都没跑出来。。。。。。借用师兄的Powersoil的试剂盒又提了一次,还是什么都没有。。。。。。土样是老师给的,经过研磨等前期处理,具体的我也不清楚,不知道会有什么影响。但不管怎么样,土壤中肯定有微生物,不应该什么都提不出来啊。。。实在想不出原因, 只好请教各位,请大家帮我分析一下,是什么原因?
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思念是一棵没有年轮的树,永不老去
1楼
2012-11-24 20:01:05
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pangzio
铁虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 7.5
帖子: 110
在线: 52小时
虫号: 596149
注册: 2008-09-08
专业: 微生物生态学
【答案】应助回帖
第一、土壤样品是什么,有可能里面所含的微生物就很少,所以跑胶的时候,你是不会看见清晰条带的,提取完直接进行PCR,要设置阴性对照,看里面是否有微量的DNA;
第二、生工的盒子没有配除腐植酸的试剂,也许是腐植酸影响了;
第三、你提取的土壤若盐、碱的含量高的话,一般的试剂盒很难提出来,反而手配的试剂好提取点,当然买个质量好点的盒子一下可以解决以上的问题。
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10楼
2012-12-22 13:41:06
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