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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 寻找基因差异
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小闲丫丫

新虫 (初入文坛)

[求助] 寻找基因差异

我是新手，刚接触分子生物学的东西。求各位详解。
我想对比一个抗性种群和一个敏感种群GSTs基因会不会存在差异和突变，具体要怎么入手开始做呢？感谢各位赐教。
求具体过程步骤
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1楼 2012-11-09 11:18:40
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lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-11-09 14:21:20
首先在gengbank里查找你所需的基因序列，然后倒入到比对软件（mega）中比对就可以知道结果！
另外你也可以找到一个基因，然后直接在网上blast，这样也会出现很多比对结果，从这些结果中尼可以发现很多意想不到结果！
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生物化学与分子生物学
2楼2012-11-09 11:24:46
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小闲丫丫

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lidonghong at 2012-11-09 11:24:46
首先在gengbank里查找你所需的基因序列，然后倒入到比对软件（mega）中比对就可以知道结果！
另外你也可以找到一个基因，然后直接在网上blast，这样也会出现很多比对结果，从这些结果中尼可以发现很多意想不到结果 ...

非常感谢！那如果这个物种的基因序列是未知的要如何做呢？
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3楼2012-11-10 10:38:58
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lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 小闲丫丫 at 2012-11-10 10:38:58
非常感谢！那如果这个物种的基因序列是未知的要如何做呢？...

你这个未知怎么解释？
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生物化学与分子生物学
4楼2012-11-13 10:02:08
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小闲丫丫

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lidonghong at 2012-11-13 10:02:08
你这个未知怎么解释？...

比如我要做的虫的基因序列不知道，但是有一个和它关系很近的一种虫的基因序列已知，我要做的是经过药物处理后这个虫的某种酶的基因变化情况，要怎么做呢？该经过哪些程序步棸，我是初学，对这些一点都不知，请老师详解，谢谢！
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5楼2012-11-13 15:28:53
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mutant

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-14 16:28:27
你要研究虫子中某种酶的基因表达变化情况，可以通过RT-PCR来进行，所以你就没有必要克隆得到出这种酶基因的全部序列，而是利用软件分析找出你们研究的这个基因保守序列部分，根据跟他关系很近的这种虫的已知基因序列，设计保守核心区的引物，得到保守核心区片段。
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6楼2012-11-13 17:41:15
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小闲丫丫

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by mutant at 2012-11-13 17:41:15
你要研究虫子中某种酶的基因表达变化情况，可以通过RT-PCR来进行，所以你就没有必要克隆得到出这种酶基因的全部序列，而是利用软件分析找出你们研究的这个基因保守序列部分，根据跟他关系很近的这种虫的已知基因序列 ...

非常感谢！现在是把已知虫的该基因找出来，用primer3在线设计了定量引物，接下来的步骤该怎么办呢？好迷茫啊~~~~~~~~~
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7楼2012-11-14 10:27:14
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mutant

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

接下来就是利用同源克隆法，克隆你所需要的序列啊
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8楼2012-11-14 20:41:28
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lidonghong

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小闲丫丫 at 2012-11-13 15:28:53
比如我要做的虫的基因序列不知道，但是有一个和它关系很近的一种虫的基因序列已知，我要做的是经过药物处理后这个虫的某种酶的基因变化情况，要怎么做呢？该经过哪些程序步棸，我是初学，对这些一点都不知，请老师 ...

6楼已经回答你了！
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生物化学与分子生物学
9楼2012-11-15 08:28:46
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雄鹰飞翔

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

最直接的方法是做基因芯片
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10楼2012-11-27 10:08:17
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