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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白肽图分析
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meldoyren

铜虫 (小有名气)

[求助] 蛋白肽图分析

小弟最经在做一蛋白的肽图，看了下别人的文章，有如下困惑，希望高人指点：
胰酶消化后的肽片段在过反相-HPLC后产生的图谱为啥只有肽段的信号，胰酶去哪了啊？为啥用胰酶消化后的肽片段打质谱也是没有胰酶信号图？甚是不解！是本身就不存在，还是作者去掉了属于胰酶~23KD的信号？求教高人解答！
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1楼 2012-11-07 17:37:23
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S0817010

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2012-11-10 09:20:30
meldoyren: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢！ 2012-11-12 10:11:37
你的酶分子量太大，在梯度内根本出不来柱子，就不要说有什么酶的信号图。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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做个秒针，也挺好的
4楼2012-11-09 16:06:26
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kellylucky

金虫 (著名写手)
想的很仔细，期待高人指点
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2楼2012-11-07 21:20:17
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
meldoyren: 金币+7, ★★★很有帮助, 谢谢指点！ 2012-11-08 09:37:28
觉得你在说LC-MS。
这个其实是3维的数据，三个轴分别是retention time, m/z and intensity，就是会有很多张不同时间的质谱图。然后把这些质谱图用软件去比对，而得到多肽。比对的时候要选择所使用的酶，自然比对结果中就会移去酶的匹配了。
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3楼2012-11-08 07:28:46
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

4楼提醒了，一般LCMS的检测范围在300-1600 m/z之间，对应的分子量就是300-5000Da。
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5楼2012-11-10 09:22:08
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