| 查看: 3495 | 回复: 13 | ||
zhen_fang银虫 (正式写手)
|
[求助]
关于LC-MS和MS/MS分析多肽氨基酸的问题
|
|
|
有两个蛋白酶把胰岛素A链和B链进行酶切，通过质谱来分析剪切位点。 想搞明白，质谱是如何分析这些剪切位点的。 求帮忙，谢了。  未命名.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
本人考085602 化学工程 专硕
已经有9人回复
-
材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐
已经有7人回复
-
326求调剂
已经有3人回复
-
焦虑
已经有8人回复
-
308求调剂
已经有4人回复
-
NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗
已经有14人回复
-
化学调剂0703
已经有7人回复
-
327求调剂
已经有11人回复
-
调剂
已经有8人回复
-
梁成伟老师课题组欢迎你的加入
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助LC-MS-MS定量问题
已经有9人回复
- 求助：多肽合成（杂质）分析！
已经有5人回复
- LC-MS条件的一般优化方法
已经有20人回复
- 生物样品LC-MS-MS分析超出线性范围最高点10倍解决方案
已经有28人回复
- 做LC-MS或者LC-MS/MS时，样品介质里是不是不能有盐酸？？
已经有7人回复
- 关于LC-MS的基质效应
已经有10人回复
- 【讨论】LC-MS/MS的问题 很多人都能碰到
已经有17人回复
- 【求助】lc-ms/ms方法介绍，定量原理
已经有9人回复
- 【求助】LC-MS重大问题，高手进
已经有16人回复
- 【求助】LC-MS检测葡萄糖及其干扰物
已经有5人回复
氢化大雪
木虫 (著名写手)
- 应助: 94 (初中生)
- 金币: 2603.8
- 散金: 10
- 红花: 6
- 帖子: 1113
- 在线: 230.9小时
- 虫号: 1956903
- 注册: 2012-08-26
- 性别: GG
- 专业: 天然药物化学
5楼2012-09-25 12:07:19
★
wizardfan: 金币+1, 谢谢参与。你不能保证楼主用的酶在mascot的列表里吧。 2012-09-27 06:06:39
wizardfan: 金币+1, 谢谢参与。你不能保证楼主用的酶在mascot的列表里吧。 2012-09-27 06:06:39
|
如果您用了酶进行剪切后，质谱在进行分析时会依次将链上氨基酸打断，从而形成一系列碎片离子，其中包含了碎裂顺序信息。如果你这个蛋白质虽然未知，但是可以确定常见蛋白质数据库里存在，比如swissprot或者ncbi中有，那么可以通过mascot等软件帮助你进行匹配检索，从而得到可能的剪切位点，但是其中分析过程还是比较复杂的。如果蛋白质序列不确定是不是在已有数据库中存在，可以使用高精度质谱，比如Orbi-HCD等方法进行高精度的肽段序列de novo，这个也是在mascot里可以自动实现的，这样的话就能帮助你快速找到酶切位点和肽段序列了。当然前提是你实验能够尽可能的纯化你的蛋白以及采用的质谱精度足够高。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
zhen_fang11楼2012-09-26 23:38:38
dshlove
木虫 (正式写手)
- BioEPI: 9
- 应助: 237 (大学生)
- 金币: 4764.7
- 散金: 20
- 红花: 10
- 帖子: 852
- 在线: 419.2小时
- 虫号: 1609389
- 注册: 2012-02-10
- 性别: GG
- 专业: 污染控制化学
2楼2012-09-24 09:30:03
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- BioEPI: 18
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24632.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
3楼2012-09-25 07:27:28
氢化大雪
木虫 (著名写手)
- 应助: 94 (初中生)
- 金币: 2603.8
- 散金: 10
- 红花: 6
- 帖子: 1113
- 在线: 230.9小时
- 虫号: 1956903
- 注册: 2012-08-26
- 性别: GG
- 专业: 天然药物化学
6楼2012-09-25 12:07:59
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- BioEPI: 18
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24632.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
10楼2012-09-26 16:17:47
zhen_fang
银虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 1330.4
- 散金: 28
- 红花: 2
- 帖子: 447
- 在线: 70.3小时
- 虫号: 1361814
- 注册: 2011-08-05
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
4楼2012-09-25 11:08:26
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- BioEPI: 18
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24632.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
7楼2012-09-25 17:27:05
zhen_fang
银虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 1330.4
- 散金: 28
- 红花: 2
- 帖子: 447
- 在线: 70.3小时
- 虫号: 1361814
- 注册: 2011-08-05
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
8楼2012-09-26 10:10:11
zhen_fang
银虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 1330.4
- 散金: 28
- 红花: 2
- 帖子: 447
- 在线: 70.3小时
- 虫号: 1361814
- 注册: 2011-08-05
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
9楼2012-09-26 10:13:06
