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zhen_fang

银虫 (正式写手)

[求助] 关于LC-MS和MS/MS分析多肽氨基酸的问题

有两个蛋白酶把胰岛素A链和B链进行酶切,通过质谱来分析剪切位点。
想搞明白,质谱是如何分析这些剪切位点的。
求帮忙,谢了。

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zhen_fang

银虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wizardfan at 2012-09-25 17:27:05
你的问题不清楚,2个蛋白酶是同时使用,还是分开使用?
不知道蛋白质序列,那只能从多肽序列来推导,多肽序列现在比较多的是从MS/MS中推导(b and y ions)。
但是如果你没有参考序列,根本不可能从多肽序列推导到 ...

是单独分开使用蛋白酶消化已知序列的多肽。

我想问的是问题是,怎么使用MS来分析这些被消化后的片段氨基酸,从而来确定剪切位点。

据我所知,可以通过数据库来分析,不知道是不是这样?

谢谢你的回答,好人一生平安,祝福。
9楼2012-09-26 10:13:06
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般是用酶去消化后,将消化终止,将消化后的样品做LC-MS或者MS/MS,就会得到一系列的片段,再比对理论片段的大小,得出酶切的位点。
2楼2012-09-24 09:30:03
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
假设你知道蛋白质的序列,
MS/MS可以用de veno的方法得到多肽序列,然后比对。
3楼2012-09-25 07:27:28
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zhen_fang

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wizardfan at 2012-09-25 07:27:28
假设你知道蛋白质的序列,
MS/MS可以用de veno的方法得到多肽序列,然后比对。

问题是不知道蛋白序列
4楼2012-09-25 11:08:26
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