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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于LC-MS和MS/MS分析多肽氨基酸的问题
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zhen_fang

银虫 (正式写手)

[求助] 关于LC-MS和MS/MS分析多肽氨基酸的问题

有两个蛋白酶把胰岛素A链和B链进行酶切，通过质谱来分析剪切位点。
想搞明白，质谱是如何分析这些剪切位点的。
求帮忙，谢了。

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1楼2012-09-22 10:29:32
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zhen_fang: 金币+5, ★★★很有帮助, 不错的小伙子 2012-09-26 10:13:24
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhen_fang at 2012-09-25 11:08:26
问题是不知道蛋白序列...

你的问题不清楚，2个蛋白酶是同时使用，还是分开使用？
不知道蛋白质序列，那只能从多肽序列来推导，多肽序列现在比较多的是从MS/MS中推导（b and y ions)。
但是如果你没有参考序列，根本不可能从多肽序列推导到蛋白质序列，比如我有2个多肽AAAA和LLLL，你不知道酶切位点，那可能是AAAALLLL也可能是LLLLAAAA。而一个蛋白质可以很大，比如1000个以上的氨基酸，太难了。
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7楼2012-09-25 17:27:05
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一般是用酶去消化后，将消化终止，将消化后的样品做LC-MS或者MS/MS，就会得到一系列的片段，再比对理论片段的大小，得出酶切的位点。
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2楼2012-09-24 09:30:03
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
假设你知道蛋白质的序列，
MS/MS可以用de veno的方法得到多肽序列，然后比对。
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3楼2012-09-25 07:27:28
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zhen_fang

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wizardfan at 2012-09-25 07:27:28
假设你知道蛋白质的序列，
MS/MS可以用de veno的方法得到多肽序列，然后比对。

问题是不知道蛋白序列
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4楼2012-09-25 11:08:26
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