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构建系统发育树的问题
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hfnanhai880
银虫
(初入文坛)
应助: 1
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金币: 391.3
帖子: 17
在线: 7.2小时
虫号: 1974036
注册: 2012-09-04
专业: 中药制剂
[
求助
]
构建系统发育树的问题
我现在要鉴定几株细菌是否为新种,测出16srDNA后,在韩国的EzBioCloud网站进行identity,将出来的一页数据用fasta输出,然后放到clustalX中进行多序列比对,去头尾之后用mega转化成.meg用NJ建树,结果出来之后很多节点的数值都非常低,请问为什么会出现这种情况?我是用58个种建的发育树,请问需不需要再去掉一些种,用离目标菌比较近的10株左右菌种再建一个树呢?另外,如果发表论文的话,是用original tree撰写论文还是用Bootstrap consensus tree呢?
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1楼
2012-09-08 13:35:12
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vaivaiann
铜虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
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红花: 1
帖子: 76
在线: 21.7小时
虫号: 1305162
注册: 2011-05-24
专业: 种群生态学
我也有同样的疑问,求助各位大侠
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2楼
2012-10-24 10:46:21
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