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shixp82

铜虫 (著名写手)

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专业: 林木遗传育种学

[求助] 如何构建极大进化树？

我想对1000多个序列构建一个进化树，查了资料觉得可以用RAxML软件来构建一个似然树，但是琢磨了好久，也不知道这个软件怎么用。
各位大侠，请问谁构建过超大的进化树，用什么软件来建？我用的是WIN7系统，软件的安装有要求吗？

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1楼 2012-08-24 16:43:29

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wittyjc

铁虫 (初入文坛)

应助: 11 (小学生)
金币: 336.9
帖子: 34
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虫号: 1738087
注册: 2012-04-05
专业: 分子与进化生态学

★ ★ ★
amisking: 金币+3, 鼓励发帖交流问题。 2012-08-24 21:35:54

ML树计算本来就慢，然后还要算这么大的树~个人想法，是不是把1000个序列做成单倍型然后对单倍型进行构树，是不是要简单一些。
我倒是觉得1000个序列的ML树一般电脑较难完成。。。

2楼2012-08-24 19:57:45

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